著名的关联分析软件Tassel 最新版5.0使用手册，在国内一直看不到，刚刚跟软件开发人员要到的，考虑到有人可能也需要，就放到这里，懂的、需要的请下载吧。       全基因组关联分析是利用遗传标记剖析复杂遗传性状的一种很热门的方法。TASSEL软件由康奈尔大学的Buckler实验室开发，它通过关联、进化和连锁进行性状分析，利用最先进的统计方法使找到QTL的统计功效最大化。TASSEL可以计算和图示连锁不平衡统计量。TASSEL的其他值得注意的特征包括一个序列比对浏览程序（sequence alignment viewer），从比对中抽出SNP和indel（插入和缺失），邻接的进化分枝图（neighbor-joining cladogram）和许多数据图示功能。TASSEL能把不同来源的数据合并到一个分析数据集中，用k最近邻算法（k-nearest-neighbor algorithm）（COVER和HART 1967）估算缺失数据，并进行主成分分析（PCA）来降低一套相关的表现型。TASSEL是用Java编写的，因此它可以在任何操作系统下使用。