a和b各3个水平，组合起来共9组。重复了4次，总共36个处理。现在做方差分析及多重比较，可以检验出a和b组内的区别。但若要比较9个组之间的差异，岂是要把它们当作9组来对待？
动物营养学报 2016，28( 3) : 720-730Chinese Journal of Animal Nutritiondoi: 10． 3969 /j． issn． 1006-267x． 2016． 03． 012陕北白绒山羊羯羊能量和蛋白质需要量高 晔1，2 李碧波2* 黄 帅1 王荣斌3 王 冬4 李琴芳5 屈 雷

是  我看这篇论文进行了九组间的 两两比较 她是不是用的单因素方差分析  两两比较？

既然这样，可将数据先整理成9组，再进行9组间的两两比较。若是在SAS里做，大概要用到Contrast语句，参见“现代统计学与SAS应用_胡良平2000,p98-108”。当然，好像SPSS里也可以做，即对变量进行recode。