我国创新药定价经历了政府定价、政府指导价和自主定价三个阶段后趋于市场化。我国创新药定价经过了政府定价、政府指导价和自主定价三个阶段的演变后，真正实现了向国际化创新药定价模式靠拢。在兼顾药企成本回收和鼓励创新药发展的双重期许下实施的创新药自主定价机制，将定价权移交给对创新药产品成本和竞争优劣更为明确的药企手中，是对创新药企的尊重并为创新药行业发展提供强大助力。2018 年成立的国家医保局将会对创新药的支付价格进行合理调整，医保局与药企之间的博弈将是创新药价格向价值回归的重要途径，并深刻影响未来创新药支付价格的定价机制。
成本和利润标准核算极具挑战，政府指导价失灵。自从 1996 年以来，中国医药行业经历了不少于 32 次整体性的强制降价，但是依然没有解决药价虚高的问题，相反医保压力却逐年增加，直到带量采购的出现。我们认为这与政府指导价的失灵紧密相关：文件中对企业期间费用率和销售利润率的核算标准规定虽然极其细致但是操作上极具挑战，价格主管部门要想掌握到所有制药企业和众多品种最真实最准确的成本数据需要较多人员配置及精力来完成，因而采取更多的是由企业上报，然后主管部门进行调整为主。这就直接导致企业虚报费用率和销售利润率的数据，再加上主管部门又无法逐个查证，最终导致药价一直居高不下的状态。正是这种看上去很“高效”的限制企业利润的指导价成为滋生高药价的温床。
值得注意的是，创新药药品定价虽然已经于 2015 年实现企业自主定价，但是仅限于药品零售价，医保支付价将在零售价基础上通过谈判方式进行调整。早期上市的创新药如康柏西普和埃克替尼等并没有及时纳入医保目录，其支付价主要是通过医院采购谈判方式确定，纳入医保目录后支付价均较零售价有明显下调（康柏西普进医保后单只药品降价 17%）。我们认为伴随着医改的持续推进以及国内医保的普及，医保支付价将逐渐占据主导地位。2018 年医保局的成立意味着支付价格的谈判主动权由医院转移给药费主要支付方医保局，虽然说权力更集中的医保局参与谈判势必会对创新药价格带来一定冲击，但是在医保局强大的支付能力和保证药品采购量的前提下，对创新药企业来说以价换量或许利大于弊。

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