肠道菌群与高脂血症相关性研究
研究目的收集2015年1月-10月中央民族大学校医院慢性病体检人员的临床生化检测信息和粪便生物样本,采用二代测序技术检测粪便样本中肠道菌群ASV（arnplicon sequence variant）的丰度,通过倾向性评分匹配法控制性别、年龄、高血压、糖尿病等混杂因素的影响,筛选出高脂血症与非高脂血症人群的差异ASV,再利用WGCNA及概率图模型（贝叶斯网络）模拟差异ASV与高脂血症的因果作用关系,为核心菌群预防与治疗高脂血症提供科学依据。研究方法菌群测序与结构分析提取各粪便样本肠道菌群总DNA,根据细菌V3-V4区设计引物（上游引物为5’-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3’,下游引物为5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’）,扩增16S rRNA基因,在illumina Hiseq2500平台上进行高通量测序,生成FASTQ格式的下机数据。
运用R软件DADA2包过滤,去重复,嵌合体识别和合并双端读取,完成物种注释;用R软件vegan包分析a多样性、β多样性,初步探索两组样品间的菌群结构差异。差异筛选与富集分析为了控制混杂因素对实 ...