海州香薷耐铜性转录组学研究及其完整叶绿体基因组解读
海州香薷是我国南方铜矿床生长的一种耐铜植物,俗称“铜草”,因为它在植物修复铜污染土壤中起着至关重要的作用,铜是一种重要的金属。然而,大多数对海州香薷耐铜的研究还未涉及其铜胁迫下转录基因的动态变化,很少有研究从遗传学和转录组的角度分析和探讨铜耐受性的相关机制。
一方面,本研究利用转录组学技术探究海州香薷对铜的耐受性。研究组装了海州香薷幼苗的根基因,在三种不同铜浓度(T1:10μmol/L Cu2+、T2:50 μmol/L Cu2+、T3:100 μmol/LCu2+)胁迫下处理7天后,以及对照组(CK)幼苗的根基因的转录组数据,从海州香薷的转录组数据注释中得到58,525个unigenes。
对差异表达基因的进行功能分析,包括海州香薷铜胁迫组间差异基因GO功能显著性富集分析和Pathway显著性富集分析。差异表达基因显著富集的通路主要是与核糖体、吞噬体、氮代谢、角质、木栓质及蜡质生物合成、细胞分裂素合成、泛醌和其他萜类化合物-醌生物合成、光合作用-触角蛋白、光合作用、光合作用中的碳固定、α-亚麻酸代谢等代谢通路。
这些代谢通路间相互联 ...