多肽分子的非谐性振动光谱解析及红外装置设计
蛋白质骨架酰胺单元的红外振动光谱因具有二级结构敏感性而被人们作为蛋白质结构研究的重要手段。近年来发展起来的飞秒激光二维红外光谱(2D IR)更是能够在飞秒级的时间分辨率上揭示蛋白质动态结构波动特征,红外光谱技术的进步对于我们深化蛋白质结构的认识有重要的帮助。
借助分子模拟手段进行蛋白质骨架酰胺单元振动光谱的模拟能够解析潜藏在光谱中的结构信息,实现对蛋白质结构的解读。蛋白质空间构象的改变将影响其正常的生理功能,探索蛋白质在碳纳米材料界面呈现的二级结构,了解其相互作用机制能够有助于设计相关药物材料,抑制蛋白质的错误折叠。
研究结果对认识并预防蛋白质构象变化所引起的疾病(如阿尔茨海默症等)具有重要意义。为提高固态和液态样品的红外光谱检测效率和检测准确度,本文设计了红外光谱实验中所需要的固体样品研磨仪以及红外液体样品池装置。
同时,我们采用量子化学计算和分子动力学模拟的方法,对二肽分子(甘氨酸二肽、丙氨酸二肽)和淀粉样蛋白Aβ(37-42)片段进行了分子动态结构模拟与非谐性振动光谱计算,获取分子中酰胺-Ⅰ带的非谐性振动光谱信息,模拟酰胺-Ⅰ带的2D  ...