陈锡康经长期研究提出了系统综合因素预测法。在预测方程中综合地反映了影响农业复杂巨系统的四大因素，即社会政策管理因素、经济技术因素、自然因素和其他因素。其核心技术主要有三个，即投入占用产出技术、考虑边际报酬递减的非线性预测方程和最小绝对和方法。每年4月底陈锡康及其合作者完成当年度全国粮食产量预测报告，5月初由中国科学院院长报送中央主要领导及中央有关部门。1980至2001年的预测结果如下：
第一，预报各年度粮食产量丰、平、欠，方向正确；
第二，预测提前期为半年以上；
第三，20多年来预测产量与全国抽样调查结果相比，平均误差为1.8%。如2001年4月末预报当年粮食产量为4590亿kg，2001年末国家统计局对全国850个县，1.8万个村，315万个样本进行实际割测，确定全国粮食产量为4526.5kg，预测误差为1.4%。
目前国际上发达国家粮食产量预测的平均误差为5%～10%。如美国农业部提前两个月对谷物产量进行预测的误差为8%～9%。此项科研工作在预测技术和实际应用上居国际领先地位。
此项预测工作获得中央领导，如李鹏、朱镕基、李岚清、邹家华、温家宝等16次以上好评。
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