内部审计机构是指在部门、单位内部从事审计工作的机构。一般的，内部审计机构是在本部门、本单位主要负责人的直接领导下，对本部门、本单位及所属单位的财务收支及经济效益进行审计监督。
常见的企业内部审计机构，根据其隶属领导关系与工作报告关系，其组织形式有三种主要模式：
（1）受主计长（相当于我国企业总会计师或财务总监）或主管财务的副总裁领导并向其报告工作；
（2）受总经理或总裁领导并向其报告工作；
（3）受董事会下属审计委员会领导并向其报告工作。
内部审计机构隶属领导层次越高，独立性越强，审计范围越广，权威性越高，越有利于发挥其作用。