审计师所收集到的审计证据，最初表现为分散的、个别的证据。为了使其具有充分的证明力，形成恰当的审计结论，还必须对其进行整理、分析与评价。需要注意的是，审计证据的收集与整理、分析、评价通常是交叉进行的。通过对已收集证据的整理、分析与评价，可以发现已有证据的不足，以便进一步收集证据。
审计证据的整理与分析没有固定模式，但其基本方法是分类、计算、比较、小结与综合。
审计师没有必要也不可能将审计证据反映的内容全部写进审计报告，因而必须对审计证据进行适当取舍，只选择那些具有代表性、典型性的审计证据在审计报告中加以反映。某些审计证据所反映的可能是一种假象，审计师必须对其分析与研究，透过形象评价其反映的本质，而不能被其假象所迷惑。
不同来源的审计证据，其可靠性可能存在差异。此外，被审计单位等审计资料的提供者可能出于某种动机而伪造证据。因此，审计师必须对获取的审计证据的可靠性进行评价，排除伪证，以可靠证据作为形成审计结论的基础。在评价审计证据时，审计师应当运用职业判断，从总体上评价是否已经获取充分、适当的审计证据，并将审计风险降至可接受的低水平。