如果认为财务报表整体是公允的，但还存在下列情形之一时，注册会计师应当出具保留意见审计报告：
（1）在获取充分、适当的审计证据后，注册会计师认为错报单独或汇总起来对财务报表影响重大，但不具有广泛性；
（2）注册会计师无法获取充分、适当的审计证据以作为形成审计意见的基础，但认为未发现的错报（如存在）对财务报表可能产生的影响重大，但不具有广泛性。
可见，导致注册会计师发表保留意见，要么是被审计单位财务报表局部不合法或不公允；要么是局部审计范围受到重大限制。