最短距离法、组间联接法和wald法为系统聚类的常用方法，每个方法之间的计算原理是不一样的，所以会有差距，其中组间联接法又称类平均法是用两个类别间各数据点两两之间的距离的平均来表示两类别间距，ward法又称利差平方和法，其思想是直接来自方差分析，是使得各个类别中的离差评方法和较小，而不同类别之间利差平方和教程大，使用该方法倾向于使得各个类别间的样本量尽可能相近。实践中，默认组间平均距离法是一种比较稳健和优异的方法。

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