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2022-4-26 15:14:00
它没有回答到检测时有多少人累计感染SARS-CoV-2的问题。表8:NPVyτ的界限σ0.6 0.85 0.98/20[62.3%,98.8%][90.0%,99.7%][98.9%,100%][10[62.3%,97.5%][90.0%,99.3%][98.9%,99.9%][2[62.3%,85.3%][90.0%,96.1%][98.9%,99.6%][20[6.2.3%,65.2%][90.0%,90.8%][98.9%,9%][1.3%][98.9%]90.0%遗传了两个缺失数据的PCR检测过程(98.3%,85.3%][98.3%][98.9%)也完善了NPA和NPV的总体患病率(98.9%)[98.9%)的检测方法(ii)缺失相关数据(不影响PCR的NPV)。表9:总人口τ的STQ NPVZ的界限σ0.6 0.85 0.98/20[40.5%,96.0%][58.5%,96.0%][64.2%,96.0%][10[41.1%,95.9%][59.4%,95.9%][65.3%,95.9%]/2[47.4%,83.4%][68.5%,94.0%][75.2%,95.2%]/20[57.2%,61.8%][82.8%,86.1%][90.9%,9.8%]3.3 BiaxNOW-CoV-1 19 Ag Home Test雅培的BiaxNOW(BiN)Covid-19 Ag Home Test是首个在家使用的快速Igen测试之一,能够检测SARS-CoV-2经美国食品药品监督管理局紧急批准的病毒(20a)。BiN的临床表现得到FDA的批准,并以PCR检测作为参考。数据如表10所示,表11显示了隐含的准确性度量。表10:FDA的BiN测试结果(2020a,第20页)z\\y y y=0 y=1 Sumz=0 73.48%3.91%77.39%z=1 1 1.09%21.52%22.61%Sum 74.57%2 5.43%相对于StQ,BiN的PPV显著较低,也排除了PCR特异性较低值的perfectPPV。另一方面,与StQ相比,净现值比BiN更大。即使是最坏情况下的PCR敏感性,BiN可能的NPV值也相当高。
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2022-4-26 15:14:06
此外,在σ处,扩张阈值非常低*= 26.7%.24.3.4检测新冠肺炎的CT扫描表11:BiNσ0.6 0.85 0.98PPVz[95.2%,100%][95.2%,100%][95.2%,97.5%]NPVz[73.0%,74.4%][89.1%,90.6%][94.3%,94.9%]扩张阈值σ的准确性*= 26.7%美国食品和药物管理局(2020a)还通过纳入PCR检测获得的循环阈值,提供了有关BiN结果的额外数据。表12显示了这些数据。表12:FDA(2020a,第21页)循环阈值计数小于33 Ct的BiN试验结果≥ 33 Sumz=0 16.2%6.94%23.12%z=1 9.83%67.05%76.89%Sum 26.01%73.99%是PCR检测产生的额外数据,可用于确定抗原检测预测值的界限。然而,需要对当前设置进行扩展,因为在二进制测试的当前设置中不考虑此类附加信息。第4.2小节讨论了当前设置的可能扩展,以允许此附加数据。3.4 CT扫描检测COVID-19Ai等(2020年)和Gietema等(2020年)建议使用胸部CT扫描来识别患者的2019冠状病毒疾病。在InGietema等人的研究中,荷兰急诊科的9名有症状的新冠肺炎患者都进行了胸部CT扫描和PCR检测,以检测SARS-CoV-2。他们的研究设计正好符合当前论文的框架:(i)测试池的非代表性抽样,以及(ii)由于使用不完善的参考测试(具有完美的特异性)而缺少相关数据。试验数据如表13所示。与之前的抗原检测研究相比,CT扫描的数据似乎与PCR检测结果不太一致。
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2022-4-26 15:14:12
这表明这种CT检查的信息量较小:σ的扩张阈值*= 63.35%高于英国反基因公共卫生部(2020年)解释道:“周期阈值(Ct)是一个半定量值,可以广泛地将RT PCR检测后患者样本中病毒遗传物质的浓度提高为低、中或高——也就是说,它告诉我们样本中大约有多少病毒遗传物质。低Ct显示病毒性物质的高浓度,通常与高感染风险相关。高Ct表明病毒l基因tic物质浓度较低,这通常与较低的感染风险有关。”表13:Gietema等人(2020年,表2)的CT扫描数据z\\y y=0 y=1 Sumz=0 38.86%4.66%43.52%z=1 18.13%3 8.34%56.48%和56.99%4 3.01%测试。因此,如果σ=60%——Alcoba Florez等人(2020年)报告的PCR检测灵敏度最低,则该检测程序完全没有信息。在这种情况下,表14显示了人口患病率、PCR NPV和CT扫描NPV。PCR(假设)的低灵敏度意味着它可能是NPV表14:Gietema等人(2020年)对总体人口的影响。τ↓ p:=p(x=1)NPVyNPVz/20[3.58%,71.7%][49.7%,98.5%][23.4%,65.1%][10[7.17%,71.7%][49.7%,97.0%][23.4%,65.1%][2[35.8%,71.7%][49.7%,81.7%][23.4%,65.1%][20[68.1%,71.7%][49.7%,54.0%][23.4%,65.1%]相当低,但至少与τ50%相近。另一方面,CT扫描既有相当大的时间间隔,也有可能出现NPV的下限。由于σ=0.6低于扩张阈值,CT扫描对受试人群完全没有信息(相当于τ=1)。此外,如果τ≥ 1/2如表14所示。
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2022-4-26 15:14:19
例如,对于非新冠病毒指示性CT扫描,一组可能的感染概率p(x=1 | z=0)与先前信息p的相关性增加。表15中显示的Ai等人(2020年)的数据更引人注目。Ai等人也使用胸部CT扫描来检测2019冠状病毒疾病。他们的数据是在中国武汉获得的,与Getema等人(2020年)的研究一样,PCR检测也被用作参考。数据显示,表观特异性非常低,但表观灵敏度f∑=96.51%。表达式(4)表明新测试ζ的高产量可能存在问题。这里,该产率非常高,ζ=87.57%。通过观察扩张阈值,问题变得更加严重,这一阈值随σ的变化而升高*= 90.74. 这意味着,即使PCR检测非常敏感,CT扫描对武汉的受试者来说也是完全没有信息的。回想一下P(x=1 | z=0)=1- NPVz。我感谢菲利普·奥布拉多维奇提供这一参考。26讨论和扩展表15:AI等人(2020年,表2)的CT扫描数据z\\y y=0 y=1 Sumz=0 10.36%2.07%12.43%z=1 30.37%5 7.20%87.57%总和40.73%5 9.27%4讨论和扩展4。1既定测试的不完全特异性和附加数据的使用假设2对于某些应用可能太强。尽管这一假设有时显著简化了代数表达式,但从概念上讲,它并不是一个重要的分类。附录A中jo int分布的关键特征可以很容易地扩展,以允许建立测试的假阳性。对新测试的评估有时比P(y,z | t=1)有更多的数据可用。例如,病毒存在之前的血液样本可以作为阴性样本。
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2022-4-26 15:14:25
另一方面,可以使用更复杂(通常更昂贵)的方法来分析特定的血液样本,而不仅仅是使用已建立的测试作为参考。这些方法将导致样本呈阳性(或至少概率非常高)。这两种方法中的任何一种都将提供额外的数据,因此也将减少丢失数据的问题。一般来说,这种补充知识会导致更窄的范围,但除非对整个受试人群使用这些额外的方法,否则缺少相关性的问题仍然存在。当然,这些方法不能应用于未经测试的人群。因此,用这些无关的数据无法避免关于患病率的缺失数据。4.2除了二元测试,当前的框架只允许测试和基本健康状态的二元结果。这似乎是诊断测试文献中研究的最常见的情况。(Zhou等人,2014年)经常试验提供三元结果(附加“非结论性”或“inva lid”结果),或允许提供更详细的信息,例如Olbrich等人(2020年)的循环阈值计数,结合这些方法评估SARS Co V-2抗体试验。如第3.3节所述的PCR检测。在这种情况下,理论分析无法提供合适的机制。然而,描述所有联合分布集合的关键应用是copula理论(Joe,1997,定理3.10)的结果,它不依赖于任何二元维度。事实上,这个结果甚至可以在每个维度上产生持续的结果。类似地,如果同时进行多个测试,可以使用Joe(1997)中的其他结果来描述可能的联合分布集,这是Zhou等人(2014年,第9章)研究的结果。
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2022-4-26 15:14:31
在这种情况下,就像附录A中的描述一样,测试数据是一个整体联合分布的高维边际分布,带有一个附加维度(健康状态)。在考虑这种扩展时,必须小心,因为有时可能的高维分布集的锐界可能未知。4.3 2019冠状病毒疾病相关检测由于检测对经济有潜在的重大影响,准确描述可用的检测技术至关重要。从微观经济学的角度来看,测试技术影响测试的最佳分配方式(seeEly等人(2020年)、Lipnowski和Ravid(2020年)),以及Acemoglu等人(202 0年)研究的参与社会对抗的人数。但同时,宏观经济受到测试策略和最佳选择的严重影响,可能会大幅降低大流行的经济成本。(Alvarez et al.,2020;Eichenbaum et a l.,2020)此外,这些研究确定了测试的重要性,并针对不同的测试技术提出了一个解决方案,所有这些研究都假设一个测试对应于一个laBlackwell(1951)的实验,因此总是具有信息性(有时甚至假设测试本身提供了完美的信息)。本文证明,只有在评估新测试时有一个完美的参考时,测试结果中明确信息的假设才适用。特别是,检测SARS-CoV-2的新抗原试验是相对于不完善的PCR试验进行评估的,因此如本文所示,这些抗原试验产生的信息不明确。最佳测试程序应考虑这种模糊性。类似地,医生指南(likeGaleotti等人(2020年);沃森等人。
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2022-4-26 15:14:38
(2020年))可能会考虑更详细地解决测试结果中的不确定性。28联合分布集的特征联合分布集的特征P(x,y,z)考虑固定的Γ:=P(y=1)∈ [τγ,γ]与相应的患病率p:=p(x=1)=Γ/σ。引理1。假设假设1和假设2成立。对于给定的Γ,P(x,y)由表16给出。表16:P(x,y)P(x\\y)y=0 y=1x=0 1的联合分布-Γ/σ 0 1 -Γ/σx=1Γ1-σσΓΓ/σ1 - ΓΓ证明。1.P(x=1,y=1)=P(y=1)- P(x=0,y=1)|{z}=0,假设2=Γ2。P(x=1,y=0)=P(x=1)- P(x=1,y=1)=Γ(1)- σ)/σ.3. P(x=0,y=0)=P(y=0)- P(x=1,y=0)=1- Γ/σ.利用全概率和重新排列定律得出P(y=1 | t=0)=Γ-τγ1-τ.此外,通过测试P(y=0,z=1 | t=0)=P(y=1,z=1 | t=0)=0的结果。因此,P(y,z)由表17给出。表17:P(y,z)P(z\\y)y=0 y=1z=0 1的联合分布- Γ - P(y=0,z=1 | t=1)τΓ- P(y=1,z=1 | t=1)τ1- τζz=1p(y=0,z=1 | t=1)τP(y=1,z=1 | t=1)ττζ1- ΓΓBy Joe(1997,定理3.10)所有分布P(x,y,z)的集合,其边缘由P(x,y)和P(y,z)所驱动,由两个极端分布所限定:FΓ≤ F≤FΓ,其中F是对应于P(x,y,z)的CDF,FΓ由表18给出,FΓ由表19给出。所有这些分布的set,通常被称为Fr’echet类,是一个凸集。
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2022-4-26 15:14:45
因此,这里只考虑极端点。参考s 29表18:CDF FΓx=1 x=0z=1 z=0 z=1 z=0y=1- τζ 1 -σmax{0,1-Γ/σ - P(y=0,z=1 | t=1)τ}y=01- Γ 1 - Γ - P(y=0,z=1 | t=1)τ1-σmax{0,1-Γ/σ - P(y=0,z=1 | t=1)τ}表19:CDF FΓx=1 x=0z=1 z=0 z=1 z=0y=1- τζ 1 -Γσmin1.-Γσ, 1 - Γ - P(y=0,z=1 | t=1)τy=0.1- Γ 1 - Γ - P(y=0,z=1 | t=1)τ1-Γσmin1.-Γσ, 1 - Γ - P(y=0,z=1 | t=1)τ因为FΓ和FΓ在Γ中都是非递增的,所以CDF因子的锐界为allΓ:=P(y=1)∈ [τγ,γ]是F:=Fγ≤ F≤Fτγ=:F。对于较低的,我们有1个-Γ/σ - P(y=0,z=1 | t=1)=(1- γ)(1 - τ) + τ.对于上限,请注意1- τγ - P(y=0,z=1 | t=1)τ=1- τ(1 -P(y=0,z=0 | t=1))。表20和表21给出了相应的概率质量函数。表20:P:=P(y=0,z=1 | t=1)x=1 x=0z=1 z=0 z=1 z=0y=1 P(y=1,z=1 | t=1)τγ的下限PMF- P(y=1,z=1 | t=1)τ0 0y=0 max0,γσ+Pτ- 1.闵γ1-σσ, 1 - γ - Pτ闵1.-γσ,Pτ最大值0, 1 -γσ- Pτ表21:P:=P(y=0,z=0 | t=1)x=1 x=0z=1 z=0 z=1 z=0y=1 P(y=1,z=1 | t=1)τP(y=1,z=0 | t=1)τ0 y=0τ的上界PMF闵γσ, 1 - P- γτmaxP+γσ- 1, 0τmax1.-γσ- P、 01.- τmaxγσ, 1 - P参考文献sAcemoglu,D.,A.Makhdoumi,A.Malekian和A.Ozdaglar(2020):“检测,自愿社交距离和感染传播”,国家经济研究局技术代表w27483,https://www.nber.org/papers/w27483.Ai杨志强、侯厚浩、詹志强、陈志强、吕文华、曹涛、孙志强、刘志强。夏(202 0):“中国2019年冠状病毒30参考病(新冠病毒-19)胸部CT和RT-PCR检测的相关性:1014例病例报告”,放射学,296,E32–E40,https://pubs.rsna.org/doi/10.1148/radiol.2020200642.Alcoba-Florez,J.,H.吉尔·坎佩西诺,D.G.-M。
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2022-4-26 15:14:52
de Artola,R.Gonz\'alez Montelongo,A.ValenzuelaFern\'andez,L.Ciuffreda和C.Flores(2020):“SARS-CoV-2检测中不同RT-qPCR解决方案的敏感性”,《国际传染性疾病杂志》,99190-192,http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1201971220306032.Alvarez,F.E.、D.Argente和F.Lippi(2020):“2019冠状病毒疾病锁定的简单规划问题”,国家经济研究局技术代表w26981,https://www.nber.org/papers/w26981.Blackwell,D.(1951):《实验的比较》,加利福尼亚大学摄政者在《第二届伯克·l·y数理统计与概率研讨会论文集》中,https://projecteuclid.org/euclid.bsmsp/1200500222.---(1953):“实验的等效比较”,数学统计分析,24265-272,https://projecteuclid.org/euclid.aoms/1177729032.Cassaniti,I.、F.Novazzi、F.Giardina、F.Salinaro、M.Sachs、S.P erlini、R.Bruno、F.Mojoli和F.Baldanti(2020):“VivaDiag 2019冠状病毒疾病IgM/IgG快速检测的性能不足以诊断急诊室D科急诊患者的2019冠状病毒疾病”,《医学病毒学杂志》,921724-1727,https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jmv.25800.de奥利夫·艾拉(Olive ira,H.(2018):“利用图表的布莱克威尔信息性定理”,《游戏与经济贝哈维奥》(Games and Economic Beh avior),109126–131,http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0899825617302270.Eichenbaum,M.S.,S.Rebelo和M.Trabandt(2020):“检测和隔离的宏观经济学”,国家经济研究局技术代表w27 104,https://www.nber.org/papers/w27104.Ely,J.,A.Gale otti,O.Jann和J.Steiner(2020):“最佳测试分配”,技术资源出版社。,http://home.cerge-ei.cz/steiner/allocation.pdf.References 31Esbin,M.N.,O.N.惠特尼,s。庄,A.毛尔r,X.达扎克,安德烈。
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2022-4-26 15:14:59
Tjian(2020):“克服广泛检测的瓶颈:快速查看2019冠状病毒疾病检测的核酸检测方法”,RNA,26771-783,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7297120/.FDA(2020a):“BinaxNOW 2019冠状病毒疾病Ag卡家庭测试:医疗保健提供者使用说明”,FDA,https://www.fda.gov/media/144574/download.---(202 0b):“EUA授权的血清学检测性能”,FDA,https://www.fda.gov/medical-devices/coronavirus-disease-2019-covid-19-emergency-use-authorizations-medical-devices/eua-authorized-serology-test-performance.Galeotti,A.,J.Steiner和P.Surico(20):“测试的优点:信息经济学的视角”,卫生政策与技术,9575-577,http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211883720300848.Gietema,H.A.,N.泽利斯,J.M.诺贝尔,L.J.G.兰布里克斯,L.B.瓦纳芬,A.M.L.O.拉霍夫,J.E.威尔德伯格,I.C.内利森,和P。M.Stassen(2020):“CT与RT-PCR在荷兰诊断新冠肺炎中的关系:一项前瞻性研究”,PLOS ONE,15,e0235844,https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0235844.Gul,F.和W.Pesendorfer(2018):“评估模糊随机变量并通过代理进行更新,”https://www.princeton.edu/~fgul/更新。pdf。Joe,H.(1997):多元模型和多元依赖概念,CRCPress。Kaiser,L.,I.Eckerle,M.Schibler和A.Berger(2020):“验证报告:SARS-CoV-2抗原快速诊断试验”,技术代表。,https://www.hug.ch/sites/interhug/files/structures/laboratoire_de_virologie/documents/Centre_maladies_virales_infectieuses/ofsp_rdt_report_gcevd_27.10.2020.pdf.Lipnowski,E.和D.Ravid(2020):“隔离决定的混合测试”,SSRN学术论文ID 3633360,纽约州罗切斯特社会科学研究网络,https://papers.ssrn.com/abstract=3633360.Machina,M.J.和M。
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2022-4-26 15:15:06
Siniscalchi(2014):“第13章——模糊和模糊规避”,《风险和不确定性经济学手册》,M.Machina和K.Viscusi主编,北荷兰,《风险和不确定性经济学手册》第1卷,729–807,http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780444536853000131.32参考文献Manski,C.F.(19 89):“选择问题的剖析”,《人力资源杂志》,24343-360,https://www.jstor.org/stable/145818.---(2018):“个性化风险评估医疗决策的可信生态推理”,数量经济学,9541–569,https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.3982/QE778.---(2020):“通过应用Covid-19抗体检测来限制诊断检测的准确性”。Manski,C.F.和F.Molinari(2021):“估计2019冠状病毒疾病感染率:推断问题的解剖学”,《计量经济学杂志》,220181-192,http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304407620301676.Olbrich他们是一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学校,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生,一个学生乌尔,霍伊舍尔先生,和A.Wieser(202 0):“一项流行病学研究的血清学策略,基于七种不同检测系统的性能比较,即慕尼黑代表性的2019冠状病毒疾病队列。”http://www.klinikum.uni-muenchen.de/Abteilung-fuer-Infektions-und-Tropenmedizin/download/de/KoCo19/KoCo19_Olbrichetal_Serostrategy_SARS-CoV-2.pdf.Public英格兰卫生部(2020):“理解周期阈值(Ct)inSARS-CoV-2 RT-PCR”,技术。
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卫生和社会保健部代表,https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/926410/Understanding_Cycle_Threshold__Ct__in_SARS-CoV-2_RT-PCR_.pdf.Reitsma,J.B.,A.W.S.Rutjes,K.S.Khan,A.Coomarasamy和P.M.Bossuyt(2009):“参考标准不完善或缺失的诊断准确性研究解决方案综述”,《临床流行病学杂志》,62797–806,http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0895435609000638.Sacks,D.W.,N.Menache mi,P.Embi和C.Wing(2020):“我们能从检测和医院数据中了解到SARS-CoV-2流行的哪些信息?”arXiv:2008.00298[经济统计],http://arxiv.org/abs/2008.00298.References 33Seidenfeld,T.和L.Wasserman(1993):“概率集合的扩张”,《统计年鉴》,21139-1154,https://projecteuclid.org/euclid.aos/1176349254.Shishkin,D.和P.Ortoleva(2020):“模棱两可的信息和解释:一个实验,”http://denisshishkin.com/papers/ambiguous_information.pdf.Stoye,J.(2020):“通过检测的选择性和准确性来界定疾病患病率:2019冠状病毒疾病病例”,arXiv:2008.061 7 8[经济,统计],http://arxiv.org/abs/2008.06178.Watson,J.、P.F.Whiting和J.E.Brush(2020):“解释新冠病毒-19测试结果”,BMJ,369,m1808,https://www.bmj.com/content/369/bmj.m1808.WHO(2020):“使用快速免疫分析诊断SARS-CoV-2感染时的抗原检测,”https://www.who.int/publications-detail-redirect/antigen-detection-in-the-diagnosis-of-sars-cov-2infection-using-rapid-immunoassays.Zhou,X-H.,N.A.小渊考夫斯基和D.K.麦克利什(2014):不可知论医学中的统计学方法,约翰·威利父子出版社。
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