最大的可能是你只添加了最外层的文件夹。
比如有一个:
mymat\folderone\xxx
mymat\otherfolder
mymat\three

你添加的时候只添加了  mymat。却没有添加其下的子文件夹。

应该这样:
file    ->          set path  ->  Add folders and subfolders
然后再选择你的 mymat ，下面的子文件夹等都会被添加。
里面的所有m文件都会被找到。

很高兴认识你，我在这个论坛看到很多你的回复帖，感谢你的热心帮助！
但是这个方法我也试过，不管用。真是太奇怪了，如果我把用到的.m文件单个的复制到work中，又可以读取，对于一些\ja或者\private中调用到的函数就不行了，然而一旦重启matlab这个小聪明就不管用了。 2# tulipsliu

呵呵，我很多帖子，也是随便说，含金量不高。没有其他人对模型的理解深入，做得更好。

MATLAB现在带有面向对象的，一些程序是面向对象的类，
文件申明以 classdef 开头，class 里，又可以定义函数，在JAVA里，叫 method 吧。也就是在class中，有 function的申明。

你的文件夹不可能被加到系统搜索路径的。两种类型的文件夹不可以被添加到路径，即使你用 set path，还是用其他。
一个是你已经写出来的 ：          \private
一个是这样开头的：                  \@myclass                     % 这代表是面向对象设计思想的类文件。

不过它的父文件夹在系统路径的话，依然可以被找到，比如 ：   mymatlab\private
已经  mywork\@myclass
通常，@myclass,
你的文件只要在  mywork ，不用设置添加 @myclass，文件里都可以调用这个文件夹里的任何文件。

不只这样，我在其他程序文件里，有的文件也有这样的问题。
比如  shape_read('...\Shapefiles\usgeography.shp')
这类程序的调用文件不在 mywork，而在其他即使被添加到路径的文件夹，依然无法正确读取这个文件。
所以，这个是个使用习惯，你可以多看看  面向对象类的调用问题。
你刚才说的 private，和 @anyclassfiles  一样，都不需要添加，只要它们在的上一层文件夹被找到，就可以使用。

addpath(genpath('D:\Program Files\MATLAB\R2010b\toolbox\XXXXX'));%%这个地方，XXXXX就是要添加进搜索路径的文件夹