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2022-5-31 05:29:15
《美国统计协会杂志》98(463):750-763。Sung,W.K.,Zheng,H.,Li,S.,Chen,R.,Liu,X.,Li,Y.,Lee,N.P.,Lee,W.H.,Ariyaratne,P.N.,Tennakoon,C.,Mulawadi,F.H.,Wong,K.F.,Liu,A.M.,Poon,R.T.,Fan,S.T.,Chan,K.L.,Gong,Z.,Hu,Y.,Lin,Z.,Wang,G.,Zhang,Q.,Barber,T.D.,Chou,W.C.,Aggarwal,A.,Hao,K.,Zhou,W.,Zhang,C.,Hardwick,J.,Buser,C.,Xu,J.,Kan,Z.,Dai,H.,Mao,M.,Reinhard,C.,Wang,J.,Luk,J.M.(2012)肝细胞癌复发性HBV整合的全基因组调查。自然遗传学44(7):765-769。Taylor,B.J.M.、Nik Zainal,S.、Wu,Y.L.、Stebbings,L.A.、Raine,K.、Campbell,P.J.、Rada,C.、Stratton,M.R.、Neuberger,M.S.(2013)DNA脱氨酶诱导突变突变阵雨,与APOBEC3B和3A侵袭性癌症相关。eLife 2:e00534。Tirode,F.、Surdez,D.、Ma,X.、Parker,M.、Le Deley,M.C.、Bahrami,A.、Zhang,Z.、Lapouble,E.、Grosset^ete Lalami,S.、Rusch,M.、Reynaud,S.、RioFrio,T.、Hedlund,E.、Wu,G.、Chen,X.、Pierron,G.、Oberlin,O.、Zaidi,S.、Lemmon,G.、Gupta,P.、Vadodaria,B.、Easton,J.、Gut,M.、Ding,L.、Mardis,E.R.、Wilson,R.K.、Shurr Thle Off,S.、Laurence,V.、Michon,J.、Marec-B’erard,P.、Gut,I.、Downing、,J.、Dyer,M.、Zhang,J.、Delattre,O。;圣裘德儿童研究医院-华盛顿大学儿科癌症基因组项目和国际癌症基因组联盟。(2014)Ewing肉瘤的基因组景观确定了一种侵袭性亚型,与Stag2和TP53突变共同关联。
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2022-5-31 05:29:18
癌症发现4(11):1342-1353。沃德尔,N.、帕吉克,M.、帕奇,A.M.、张,D.K.、卡萨恩,K.S.、贝利,P.、约翰,A.L.、米勒,D.、诺内斯,K.、奎克,K.、奎因,M.C.、罗伯逊,A.J.、法德卢拉,M.Z.、布鲁克斯纳,T.J.、克里斯,A.N.、哈利旺,I.、伊德里索格鲁,S.、曼宁,S.、诺斯,C.、努尔巴什,E.、瓦尼,S.、威尔逊,P.J.、马克汉姆,E.、克罗南、安德森,M.J.、Fink、J.L.、Holmes、O.、Kazako Off、S.H.、Leonard、C.、Newell、F。,Poudel,B.、Song,S.、Taylor,D.、Waddell,N.、Wood,S.、Xu,Q.、Wu,J.、Pinese,M.、Cowley,M.J.、Lee,H.C.、Jones,M.D.、Nagrial,A.M.、Humphris,J.、Chantrill,L.A.、Chin,V.、Steinmann,A.M.、Mawson,A.、Humphrey,E.S.、Colvin,E.K.、Chou,A.、Scarlett,C.J.、Pinho,A.V.、GiryLaterriere,M.、Rooman,I.、Samra,J.S.、Kench,E.J.G.、Pettitt,J.A.、Merrett,N.D.、Toon,C.、Epari,K.、Nguyen,N.Q。,Barbour,A.、Zeps,N.、Jamieson,N.B.、Graham,J.S.、Niclou,S.P.、Bjerkvig,R.、Gr–utzmann,R.、Aust,D.、Hruban,R.H.、Maitra,A.、Iacobuzio Donahue,C.A.、Wolfgang,C.L.、Morgan,R.A.、Lawlor,R.T.、Corbo,V.、Bassi,C.、Falconi,M.、Zamboni,G.、Tortora,G.、Tempero,M.A。;澳大利亚胰腺癌基因组计划,Gill,A.J.、Eshleman,J.R.、Pilarsky,C.、Scarpa,A.、Musgrove,E.A.、Pearson,J.V.、Biankin,A.V.、Grimmond,S.M.(2015)全基因组重新定义了胰腺癌的突变格局。《自然》518(7540):495-501。Wang,K.,Yuen,S.T.,Xu,J.,Lee,S.P.,Yan,H.H.,Shi,S.T.,Siu,H.C.,Deng,S.,Chu,K.M.,Law,S.,Chan,K.H.,Chan,A.S.,Tsui,W.Y.,Ho,S.L.,Chan,A.K.,Man,J.L.,Foglizzo,V.,Ng,M.K.,Chan,A.S.,Ching,G.H.,Xie,T.,Fernandez,J.,Li,V.S.,Clevers,H.,Rejto,P.A.,Wan Mao,M.,Leung,S、 Y.(2014)全基因组测序和综合分子生物学鉴定胃癌的新驱动突变。
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2022-5-31 05:29:21
自然遗传学46(6):573-582。Xuan,D.,Li,G.,Cai,Q.,Deming Halverson,S.,Shrubsole,M.J.,Shu,X.O.,Kelley,M.C.,Zheng,W.,Long,J.(2013)APOBEC3缺失多态性与欧洲血统女性乳腺癌风险相关。致癌34(10):2240-2243。Yang,W.,Gibson,J.D.和He,T.(2005)效率和有损源编码。IEEE信息论学报51(1):381-386。Zhang,J.、Wu,G.、Miller,C.P.、Tatevossian,R.G.、Dalton,J.D.、Tang,B.、Orisme,W.、Punchihewa,C.、Parker,M.、Qaddoumi,I.、Boop,F.A.、Lu,C.、Kandoth,C.、Ding,L.、Lee,R.、Huether,R.、Chen,X.、Hedlund,E.、Nagahawatte,P.、Rusch,M.、Boggs,K.、Cheng,J.、Becksfort,J.、Ma,J.、Song,G.、Li,Y.、Wei,L.、Wang,J.、Shurtle ffi,F S.、Easton,J.、Zhao,D.、Fulton,R.S.、Fulton,L.L.、Dooling、,D.J.、Vadodaria,B.、Mulder,H.L.、Tang,C.、Ochoa,K.、Mullighan,C.G.、Gajjar,A.、Kriwacki,R.、Sheer,D.、Gilbertson,R.J.、Mardis,E.R.、Wilson,R.K.、Downing,J.R.、Baker,S.J.、Ellison,D.W。;华盛顿大学圣犹大儿童研究医院儿科癌症基因组项目。(2013)全基因组测序确定了儿童低级别胶质瘤的基因改变。自然遗传学45(6):602-612。表1:基因组数据汇总。所有脑下部胶质瘤样本均为毛细胞星形细胞瘤样本。
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2022-5-31 05:29:24
数据源定义见第3.1小节。癌症类型样本总数#来源B细胞淋巴瘤43626 24 A1-2骨癌36374 98 B1脑低级别胶质瘤3572 101 A1,C1乳腺癌254381 119 A1,D1慢性淋巴细胞白血病19489 134 A1,E1-2食管癌1064 17 F1胃癌1996615 100 G1肝癌3017487 389 H1-2肺癌449527 I1髓母细胞瘤44689 100 J1卵巢癌668918 84 K1胰腺癌5087 100 L1前列腺癌29142 5 M1肾细胞癌483329 94 N1所有癌症类型7053300 1389上表2:基因组数据的前48个突变类别的发生计数汇总于表1按癌症类型汇总。X1=B细胞淋巴瘤,X2=骨癌,X3=脑低级胶质瘤,X4=乳腺癌,X5=慢性淋巴细胞白血病,X6=食管癌,X7=胃癌,X8=肝癌,X9=肺癌,X10=髓母细胞瘤,X11=卵巢癌,X12=胰腺癌,X13=前列腺癌,X14=肾细胞癌。
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