第一，paperyy免费版只收录近五年的数据库，若你的论文在写作的时候参考的论文是五年以前的，那么你借鉴的句子可能在paperyy中查不出来，导致查重率虚低；若参考的论文都是近五年的，那么免费版和至尊版的查重结果相近。

第二，paperyy的免费版及至尊版对知网的最新文献未有收录，如果你的论文大段借鉴了知网上新上架的论文，那么再用paperyy查的时候这部分借鉴的内容可能不会标红；但是知网的数据库是完备的，到知网查就不会这么幸运了，这是paperyy查重率虚低的又一原因。

第三，知网和paperyy对于句子重复的判断标准有所不同。首先，知网是有5%阈值的，也就是说如果论文的一个自然段低于5%的抄袭或引用是不会标红的，其次，若超过了5%的阈值，知网的标红条件是连续13个字相同或相似。而据笔者的查重经历来看，paperyy的标红标准要比知网更加严苛，也就是说paperyy更容易标红。其原因可能是paperyy或许没有阀值设定，以及语句相似的标准比知网更严苛，因为我自己论文好多句子明明是用自己的数据分析的，数据都和其他论文不一样，却因为这句话的表述和其他论文的表述差不多而标红，这种句子在知网查可能是不会标红的。第三点是paperyy查重率可能高于知网的原因。