ggplot2 好书!
1 Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.1 Welcome to ggplot2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.2 Other resources . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3 What is the grammar of graphics? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.4 How does ggplot2 fit in with other R graphics? . . . . . . . . . . . . . 4
1.5 About this book . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
1.6 Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.7 Acknowledgements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
2 Getting started with qplot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.2 Datasets . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.3 Basic use . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.4 Colour, size, shape and other aesthetic attributes . . . . . . . . . . . . 12
2.5 Plot geoms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
2.5.1 Adding a smoother to a plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
2.5.2 Boxplots and jittered points . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
2.5.3 Histogram and density plots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
2.5.4 Bar charts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
2.5.5 Time series with line and path plots . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
2.6 Faceting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
2.7 Other options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
2.8 Differences from plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
3 Mastering the grammar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
3.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
3.2 Fuel economy data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
3.3 Building a scatterplot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
3.4 A more complex plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
3.5 Components of the layered grammar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
3.5.1 Layers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
3.5.2 Scales . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
3.5.3 Coordinate system . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
3.5.4 Faceting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
3.6 Data structures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
4 Build a plot layer by layer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
4.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
4.2 Creating a plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
4.3 Layers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
4.4 Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
4.5 Aesthetic mappings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
4.5.1 Plots and layers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
4.5.2 Setting vs. mapping . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
4.5.3 Grouping . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
4.5.4 Matching aesthetics to graphic objects . . . . . . . . . . . . . . . 52
4.6 Geoms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
4.7 Stat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
4.8 Position adjustments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
4.9 Pulling it all together . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
4.9.1 Combining geoms and stats . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60
4.9.2 Displaying precomputed statistics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
4.9.3 Varying aesthetics and data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
5 Toolbox . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
5.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
5.2 Overall layering strategy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
5.3 Basic plot types . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
5.4 Displaying distributions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
5.5 Dealing with overplotting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
5.6 Surface plots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
5.7 Drawing maps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
5.8 Revealing uncertainty . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
5.9 Statistical summaries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
5.9.1 Individual summary functions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
5.9.2 Single summary function . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
5.10 Annotating a plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
5.11 Weighted data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
6 Scales, axes and legends . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
6.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
6.2 How scales work . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92
6.3 Usage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
6.4 Scale details . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96
6.4.1 Common arguments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96
6.4.2 Position scales . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98
6.4.3 Colour . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102
6.4.4 The manual discrete scale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
6.4.5 The identity scale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109