关于核主成分分析

perfect-秋

7428

收藏 2011-09-14

悬赏 5 个论坛币未解决

我这边有一组数据，想做logistic回归，里面的自变量基本上都是分类变量，自变量有20多个，我想先提取主成分，但是PCA比较适合于线性数据，这种二分类的不适合，看过文献提示可用KPCA，但是没用过MATLAB编写这个程序，想请各位大侠帮帮忙哈，这个MATLAB的程序是咋样哈？？？如有需要我可以把数据提上来哈！

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perfect-秋

2011-9-15 18:39:25

没人顶啊，各位大侠帮帮忙啊！

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epoh

2011-9-16 20:49:10

Kernel Statistics toolbox
Table of Contents
=================
- Introduction
- Key Features
- Data Format
For classification
For regression
- Code Usage with Examples
KDR
UseKDR
KPCA
KSIR
- Dimension Reduction Using KPCA or KSIR with Examples
KPCA procedure
KSIR procedure for classification
KSIR procedure for regression

KStattoolbox.zip

KStattoolbox.zip
大小:(224.4 KB)

马上下载

本附件包括：

Housing_dataset.txt
Ionosphere_dataset.mat
KDR.m
KPCA.m
KSIR.m
README
README.pdf
srsplit.m
SVKernel_C.m
SVKernel_EX.dll
UseKDR.m

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perfect-秋

2011-10-20 17:41:50

epoh 发表于 2011-9-16 20:49
Kernel Statistics toolbox
Table of Contents
=================

不好意思，现在才看到哈
那请问大师，这样的数字可以用核主成分分析+logistic分析它的影响因素嘛？
还有就是，这个你给的程序我直接用数据套用嘛？

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epoh

2011-10-20 22:04:17

参考范例

数据格式,直接参照Ionosphere_dataset.mat

将数据存成.txt也可以

他的label是1,-1

你要改成1,2也可以

readme.pdf page 6/7
Dimension Reduction Using KPCA or KSIR with Examples
KPCA procedure
%%%%%%%%
%load data
load Ionosphere_dataset.mat
%Construct PCs via KPCA
[Info] = KDR([], inst, '-s 0 -t 2 -g 0.1 -p 10');

%Get the projected inst form the PCs
[ProjInst] = UseKDR(inst, Info)

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perfect-秋

2011-10-21 16:50:07

弱弱的说句，跑不出来

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epoh

2011-10-21 17:53:33

%1.get current working directory.
pwd
  %C:\Users\...\Documents\MATLAB
%2.put KStattoolbox folder in current working directory
%3.set path in matlab:
   File\Set Path\add folder:
   C:\Users\...\Documents\MATLAB\KStattoolbox
%4.in matlab command window
load Ionosphere_dataset.mat
[Info] = KDR([], inst, '-s 0 -t 2 -g 0.1 -p 10');
[ProjInst] = UseKDR(inst, Info)

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zhangtao

2011-10-23 09:40:37

ProjInst =

Columns 1 through 7

-0.9648 -0.5063 -0.3472 -0.1082 0.3419 0.3317 0.1697
-1.1787 -0.5114 -0.2184 0.0824 0.2076 0.1918 0.0523
-0.7004 -0.6757 -0.2881 -0.1185 0.3505 0.2676 0.2273
-0.5537 -0.3573 -0.3622 -0.2014 0.4023 0.4238 0.2828
-0.8313 -0.2382 -0.4000 -0.0958 0.4347 0.4126 0.1361
-0.6519 -0.2053 -0.3992 -0.1424 0.4533 0.4663 0.2050
-0.9755 -0.2114 -0.3909 -0.0020 0.4011 0.3279 0.0236
-1.0575 -0.2045 0.1558 0.3684 -0.1596 -0.0777 -0.0716
-1.2431 -0.3549 0.0449 0.2952 -0.0456 0.0130 -0.0475
-1.0042 -0.7466 0.1517 0.1521 -0.1417 0.0339 0.0571
-1.0911 -0.2142 -0.3409 0.0873 0.3171 0.2358 -0.0591
-1.2483 -0.5202 -0.0536 0.1703 0.0686 0.1281 0.0393
-1.1743 -0.3400 -0.2738 0.1117 0.2491 0.2014 -0.0193
-0.5734 -0.2450 -0.3345 -0.1331 0.3804 0.3772 0.1985
-0.4795 -0.1771 0.4167 0.2798 -0.2415 0.1127 0.2328
-0.8991 -0.0973 -0.3694 0.0595 0.3746 0.2601 -0.0829
-0.9958 -0.3632 -0.3946 -0.0734 0.3905 0.3533 0.1175
-0.9483 -0.1806 -0.1277 0.1728 0.0777 -0.0045 -0.1287
-1.2194 -0.2367 -0.2073 0.2096 0.1680 0.0883 -0.1296
-1.2535 -0.4128 0.0578 0.2699 -0.0439 0.0285 -0.0150
-0.6738 -0.5346 0.5875 0.2848 -0.1522 0.3004 0.2590
-0.6957 -0.7465 0.4728 0.2312 -0.0930 0.2911 0.1456
-0.8378 -0.2184 -0.4197 -0.0768 0.4470 0.4131 0.1145
-1.0995 -0.2210 -0.3467 0.0837 0.3267 0.2369 -0.0568
-1.2289 -0.2922 -0.2298 0.1683 0.1933 0.1274 -0.0852
-1.0145 -0.3310 -0.0968 0.1339 0.0613 0.0108 -0.0489
-0.0180 -0.2720 -0.3217 0.4414 -0.1079 0.0850 0.2182
-1.1372 -0.2148 -0.3124 0.1337 0.2689 0.1746 -0.1090
-1.0672 -0.2004 -0.2094 0.1874 0.1826 0.1053 -0.1118
-1.1814 -0.2868 0.1015 0.3423 -0.1132 -0.0346 -0.0671
-1.0716 -0.4047 0.3059 0.3405 -0.2016 0.0549 0.0972
-0.7762 -0.4875 0.5298 0.3098 -0.2155 0.2212 0.2473
-1.0615 -0.2976 -0.1161 0.1941 0.0441 0.0856 -0.0729
-1.1641 -0.2291 -0.0962 0.2762 0.0527 0.0164 -0.1447
-0.0672 -0.4669 -0.4333 0.5728 -0.0657 0.0455 0.2771
-0.7910 -0.2271 0.3753 0.3598 -0.2709 0.0205 0.1314
-0.6092 -0.4453 0.5868 0.2884 -0.1877 0.2881 0.2834
-0.8105 -0.3677 0.4763 0.3347 -0.2498 0.1419 0.2250
-0.8913 -0.4065 0.4500 0.3368 -0.2361 0.1289 0.2004
-0.2610 -0.2157 0.4403 0.2002 -0.1063 0.2827 0.2373
-0.7057 -0.0800 -0.3129 0.0437 0.3097 0.2321 -0.0511
-0.6235 -0.5900 0.6040 0.2592 -0.1137 0.3310 0.2370
-1.2235 -0.6144 -0.1149 0.0920 0.0667 0.0943 0.0366
-1.2493 -0.5192 -0.1487 0.1428 0.0242 0.0544 -0.0506
-1.1050 -0.8722 -0.0085 0.0258 -0.0965 0.0490 0.0286
-0.9640 -0.4307 0.3446 0.3045 -0.2407 0.0654 0.1312
-1.0350 -0.8178 -0.1307 0.0579 0.0022 0.0939 0.0564
-1.0717 -0.8425 -0.1150 -0.0310 -0.0090 0.0497 0.0397
-0.1486 -0.6703 0.3950 0.3379 0.5542 0.1979 -0.3230
-0.0864 -0.6111 0.2525 0.4021 0.6058 0.0499 -0.3340
-1.2364 -0.6110 0.0445 0.1927 -0.0812 0.0555 0.0206
-1.1879 -0.1903 -0.2240 0.2161 0.1771 0.0764 -0.1654
-1.1429 -0.2383 -0.2905 0.1177 0.2422 0.1508 -0.1060
-0.9730 -0.1365 -0.2637 0.1302 0.2417 0.1212 -0.1302
-1.2233 -0.2777 -0.2082 0.1795 0.1661 0.0836 -0.1138
-0.5167 -0.1023 -0.3416 -0.1113 0.3912 0.3960 0.1333
-0.1761 -0.7636 0.3149 0.3866 0.5728 0.1174 -0.2975
-0.1088 -0.6730 0.1933 0.4550 0.6016 0.0093 -0.2762
-0.8617 -1.0920 -0.1045 -0.1161 -0.0193 0.0380 0.0003
-1.2351 -0.5506 0.0797 0.2307 -0.0709 0.0533 0.0294
-1.1964 -0.2356 -0.1922 0.2106 0.1438 0.0461 -0.1489
-0.8521 -0.3242 -0.0533 0.1307 -0.0078 0.0161 -0.0320
-1.0119 -0.9293 -0.1603 -0.0634 0.0375 0.0588 0.0548
-0.8305 -0.4840 0.3994 0.2570 -0.1777 0.1389 0.1788
-1.2204 -0.2196 -0.1375 0.2655 0.0867 0.0143 -0.1632
-1.2115 -0.2009 -0.1155 0.2846 0.0648 -0.0083 -0.1757
-0.8958 -1.0922 -0.0062 -0.0460 -0.0050 0.0793 0.0231
-0.3002 -0.9636 0.2753 0.2193 0.4129 0.0804 -0.2472
-0.1105 -0.7035 0.1088 0.4789 0.5852 -0.0573 -0.2220
-1.0624 -0.8582 -0.0098 -0.0292 -0.0244 0.0235 0.0574
-1.0881 -0.5570 -0.2171 0.0228 0.1769 0.1466 0.0588
-1.2292 -0.2346 -0.1047 0.2799 0.0472 -0.0089 -0.1614
-0.5928 -1.1654 -0.1033 -0.1179 0.0231 -0.0157 -0.0861
-0.5608 -1.2109 -0.1018 0.0260 0.0354 0.0222 -0.1186
-1.2030 -0.2041 -0.0803 0.2970 0.0374 -0.0266 -0.1693
-1.2205 -0.2354 -0.0583 0.3015 0.0074 -0.0292 -0.1506
-1.2414 -0.6154 0.0079 0.1505 -0.0736 0.0297 0.0074
-0.1681 -0.8179 -0.4624 0.6772 0.0216 0.0190 0.1769
-1.2844 -0.4619 -0.0784 0.1947 0.0139 0.0224 -0.0514
-0.3399 -1.0937 -0.3019 0.3665 0.0582 -0.0121 -0.0409
-0.2288 -0.6186 -0.3076 0.2002 -0.4028 0.4911 -0.4022
-1.2737 -0.3913 -0.1162 0.2081 0.0473 0.0385 -0.0851
-0.1528 -0.5511 -0.3476 0.2655 -0.4255 0.5315 -0.4109
-0.1048 -0.4039 -0.3172 0.2593 -0.4148 0.5493 -0.3994
-0.0953 -0.3814 -0.2319 0.1515 -0.3541 0.4441 -0.3921
-1.1029 -0.4418 0.1456 0.2750 -0.1438 0.0121 0.0169
-1.2205 -0.3227 -0.1289 0.2221 0.0567 0.0235 -0.1079

Columns 8 through 10

0.0347 0.0770 -0.1116
0.0174 -0.0038 -0.0519
-0.0035 0.1400 -0.1641
0.0731 0.2640 -0.1467
0.1781 0.1707 -0.0233
0.1831 0.2348 -0.0588
0.2198 0.0953 0.0259
0.2095 0.1003 -0.2035
0.1107 0.0462 -0.0997
-0.0471 -0.0005 0.0172
0.1914 0.0854 0.0619
-0.0122 0.0635 -0.0184
0.1115 0.0588 0.0233
0.1211 0.0968 -0.1440
0.3052 0.2209 -0.3049
0.3175 0.0341 0.0532
0.1080 0.1114 -0.0233
0.1391 0.1044 0.1177
0.1793 0.0246 0.0065
0.0740 0.0382 -0.0868
0.2265 0.0704 -0.0956
0.1409 -0.0158 -0.0428
0.2091 0.1504 -0.0158
0.2095 0.0388 0.0234
0.1439 0.0160 0.0009
0.1001 -0.1797 -0.1503
0.0868 -0.2023 0.1980
0.2094 0.0031 0.0129
0.1888 0.0089 -0.0087
0.1416 0.1281 -0.0978
0.1206 0.1579 -0.1607
0.1961 0.1302 -0.1549
0.0316 0.1285 0.0339
0.1687 -0.0365 -0.1019
0.1183 -0.1482 0.1503
0.2431 0.2627 -0.2558
0.2657 0.1145 -0.1331
0.2192 0.1868 -0.2215
0.1932 0.1591 -0.2125
0.2901 0.0751 -0.1061
0.2388 0.1454 0.1511
0.2303 0.0315 -0.0411
-0.0393 -0.0322 -0.0422
-0.0200 0.0147 0.0294
-0.0583 -0.0207 -0.0267
0.0969 0.2227 -0.0988
-0.1253 0.0092 0.0008
-0.0783 -0.0416 -0.0040
-0.0101 -0.0443 0.0353
-0.1196 0.0779 -0.1283
-0.0308 -0.0126 -0.0790
0.2181 0.0151 0.0171
0.1942 -0.0164 0.0053
0.2604 -0.0806 -0.0271
0.1818 -0.0658 -0.0640
0.2389 0.1574 -0.0541
-0.0354 0.0218 -0.0480
-0.1268 0.1112 -0.1735
0.0253 0.0373 0.0020
0.0139 0.0402 -0.0625
0.1752 -0.0120 0.0246
-0.0006 0.0534 0.0340
-0.0422 -0.1076 -0.0952
0.1148 0.0816 -0.1407
0.1795 0.0276 -0.0059
0.1960 0.0366 -0.0128
0.0275 -0.0220 -0.0416
0.1390 0.0219 0.0169
-0.1169 0.1536 -0.2289
-0.0580 -0.0709 -0.0077
0.0075 -0.0783 -0.0969
0.1704 0.0315 -0.0228
0.2103 0.0889 -0.0329
0.1923 0.1109 -0.0102
0.2078 0.0148 -0.0519
0.1554 0.0688 -0.0135
-0.0483 0.0377 0.0022
0.1305 -0.0085 0.0199
0.0276 -0.0148 -0.0313

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zhangtao

2011-10-23 09:46:11

以上结果是什么意思，看不懂？

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perfect-秋

2011-11-26 14:34:12

epoh 发表于 2011-10-21 17:53
%1.get current working directory.
pwd
%C:\Users\...\Documents\MATLAB

哎，我知识太浅薄了，需要现实中请教老师哈，不过这个论坛币给你哈

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perfect-秋

2011-11-26 14:35:01

这个论坛币怎么给啊？

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江苏大将

2013-2-28 19:32:05

楼主，你好，我最近也想用KPCA+logistic做点东西，不知道你做出来没有，谢谢！

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许小草five

2014-2-27 14:24:14

弱弱问一句核函数式系统自己选还是要自己事先选择好输入软件

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sinochina

2015-5-31 21:28:36

挺好的解答！！

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丢弃的麦穗

2015-9-13 10:28:17

学习学习学习，最近在学KPCA

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jjxm20060807

2015-9-18 06:50:15

共同学习

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