一、. 数据挖掘及代码课程涉及的主要内容内容

11.寻找差异基因和制作5年生存率

10.TCGA数据整理和基因注释

1.数据挖掘概述

9TCGA数据下载

8蛋白互作网络

7KEGG分析

6富集分析

5寻找差异基因及制作热图和火山图

4原始数据预处理

3.GEO数据下载和数据质量分析

2.GEO在线工具的应用

13.Oncomine之差异分析及共表达分析

12.Oncomine概述及Meta分析

11.寻找差异基因和制作5年生存率

上面内容所涉及的课程代码：
TCGA.txt
perl
mRNA_merge.pl
putFilesToOneDir.pl
survival_time.pl
更新代码
GEO.txt
TCGA.txt
资料（脚本及源码）
perl



二、TCGA 补充包，数据下载/差异分析/生存分析
5行R代码搞定表达芯片数据处理-jmzeng