类风湿关节炎患者与健康人肠道菌群的比较研究
目的:通过16SrDNA基因测序方法对RA患者与健康人肠道菌群进行比较,初步探索RA患者肠道菌群结构及多样性特征,为RA诊疗提供一定的理论依据。方法:本研究纳入15例初诊RA患者,10例健康人作为对照,收集RA患者及健康对照者的新鲜粪便样本,所收集的粪便标本在干冰低温条件下运送至实验室,利用基因提取试剂盒提取粪便样本中细菌总DNA,通过PCR扩增后使用HiSeq进行上机测序。
测序结果进行分类操作单元(OTUs)聚类和物种分类分析及物种注释、α-多样性分析、β-多样性分析等微生物信息学相关分析,最后比较RA患者与健康对照组之间肠道菌群差异。结果:1.本次纳入研究的类风湿关节炎患者及健康对照者在性别、年龄、BMI上无统计学意义(P>0.05)。
2.经OTU聚类分析共获得个3851个OTU,在门分类水平上,类风湿关节炎组在产氧光菌门、梭杆菌门丰度增多(P<0.05),在变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、纤维菌门丰度降低(P<0.05)。在属分类水平上,类风湿关节炎组在Faecalibacterium属、拟杆菌属(Bacteroid ...