分子模拟和化学计量学相结合研究药物配体与其受体之间的相互作用
本文通过分子对接法和定量构效关系法(QSAR)研究了两类化合物(孕激素类化合物与肉桂酰胺类化合物)与相应受体蛋白(PR、HDAC1)之间的相互作用机制,为两类药物的进一步研究分析提供理论指导。本论文主要针对以下四个方面进行阐述:第一章,简要介绍了分子对接法和定量构效关系法的原理和方法,并介绍了文中涉及到的几款常用软件。
最后对孕激素类衍生物和肉桂酰胺类化合物的研究进展进行了简要阐述。第二章,将孕激素类衍生物与PR受体进行对接及QSAR分析,两者的结果显示结合的作用力主要是氢键和范德华力;而孕激素类衍生物与SHBG受体之间的对接结果以及QSAR研究同样显示,氢键和范德华作用是两者的主要影响因素。
利用QSAR方法建立孕激素类衍生物-PR/SHBG的最优模型中的R值分别为0.95,0.92,通过对两者结果的综合分析,发现范德华作用、氢键作用、静电作用对孕激素类化合物与PR/SHBG的影响作用存在细微差异,这些差异可以为该类化合物的进一步研究提供理论指导。第三章,利用同源建模的方法构建了HDAC1蛋白,并将构建的受体蛋白与肉桂酰胺 ...