2011年12月2日，中国科学技术信息研究所（以下简称中信所）在北京公布了“2010年度中国科技论文统计结果”。根据该统计结果，在反映论文数量和质量的主要指标方面，上海交大均取得显著成绩：“世界四大名刊”论文数（10篇）排名全国高校第一；国内科技论文数居全国高校第一；SCI论文数继续保持全国高校第二，医学学科SCI论文数列全国高校第一。　
科技论文数量稳中有升。2010年度中信所继续淡化科技论文数排名，只统计了各机构国际论文增长趋势。根据增长趋势计算，2010年度上海交大SCI收录论文数3258篇，较上年增加118篇，继续保持全国高校第二（浙江大学依然居全国高校第一）；从各学科SCI收录论文数来看，医学学科SCI论文数列全国高校第一，生物学SCI论文数居全国高校第二，材料学、物理学和农学SCI论文数均进入全国高校前10名。EI收录论文数2756篇，较上年增加120篇，继续居全国高校第四。SSCI收录论文数88篇，列全国高校第三；上海交大国内科技论文数7932篇，居全国高校第一。
　　科技论文质量快速发展。从国际顶尖期刊看，2010年度上海交大被SCIENCE、NATURE、CELL和PNAS四大世界名刊收录论文共10篇，首次居全国高校第一；SCI各学科影响因子前1/10的期刊论文数31篇，全国高校排名第四。作为第一作者国际合著论文495篇，居全国高校第四。2008年度中信所首次对SCI“表现不俗”论文（超过所在学科论文被引次数世界均值）进行了统计，从该指标看，2010年度上海交大“表现不俗”论文共702篇，较上年增加141篇，居全国高校第三。医学院瑞金医院“表现不俗”论文57篇，较上年大幅增加30篇，并列居全国医疗机构第二（四川大学华西医院第一），仁济医院（36篇）和第六人民医院（35篇）再次进入前10，分别居第六和第九。
　　2010年度上海交大国内论文被引30136次，居全国高校第二。从SCI论文引文看，2010年度上海交大即年被引国际论文数1190篇，全国高校排名第三；2010年度上海交大国际论文被引3900篇、10143次（2005-2009年收录的论文在2010年被引用的情况），同比大幅增加1367篇、1366次，继续保持全国高校第四。2001-2010年上海交大SCI收录论文累积被引13780篇、110216次，同比大幅增加4136篇、39147次，继续保持全国高校第四。2010年度瑞金医院国际论文被引210篇、670次，居全国医疗机构第四；瑞金医院2001-2010年度国际论文累计被引725篇、6417次，列全国医疗机构第四，第六人民医院十年累计被引385篇、2059次，进入全国医疗机构前20名。
　　从高被引论文看，化工学院颜德岳院士的1篇综述性论文进入“2001-2010年度我国论文累计被引处于本学科世界前1%的论文中被引次数最高的10篇论文”；3篇论文被确定为“2010年中国百篇最具有影响的国际学术论文”，并列居全国高校第三。
　　以上数据显示，在国家经济社会快速发展的大背景下，上海交大牢牢抓住难得的机遇发展和壮大自己，瞄准国际科学前沿，以敢为人先的大无畏精神，不断攀登科学高峰，通过加强内涵建设、人才队伍建设和体制机制创新，强化对高水平科研的指引，引导教师注重学术追求，取消科学研究的功利化倾向，从而使得上海交大从事基础研究和应用基础研究的水平和能力得以大幅提升，不仅实现科技论文数量快速增长，而且促进论文质量明显提高，国际学术影响力不断攀升，为建设创新型国家做出了重要贡献。