An Introduction to R: Software for Statistical Modelling & Computing，R官方站上的免费教程，钱松老师推荐为是最好的入门讲义。
Introductory Statistics with R，springer出版的佳作，入门推荐，整体简洁清晰，讲解常规方法比较细致一些，除经典统计内容外还涉及到了生存分析，logistic回归和非线性拟合的内容。
R in Action（入门最佳），由Quick-R站长所著，分为三个层次讲解的中级统计教程，排版精致，讲到很多较新的扩展包。
Linear Models with R，关于经典线性模型的教材，讲解有一定深度，需要有一定的概率统计基础。
Extending the Linear Model with R 线性模型的扩展，和上一本书是同一作者，公式较多，对广义线性模型、加性模型、非线性模型等讲解最为详细。
Applied Econometrics with R，是Use R!系列中的一本，为计量经济学中之应用。
Exploratory multivariate analsis by Example Using R，多元方面的书，较为简洁，例子不错。
A Handbook of Statistical Analyses Using R（推荐），非常经典的中级统计（条件推断、荟萃分析和面板数据分析尤其出色）主要通过案例讲解，基本没有公式。
Introductory time series with R，Use R!系列的另一本，用它来入门时间序列很不错，如果要深入一些可以看time series analysis: with applications in R，这本书华章出了中文版。
A first course in statistical programming with R，关于科学计算方面的R语言教材，入门水平。如果要更进一步可以去看Introduction to Scientific Programming and Simulation Using R
R cookbook，菜谱式参考书，主题清楚方便查找。另一本相关的是R graph cookbook，绘图方面的必备参考书，以R语言基本绘图命令为主，还涉及到headmap以及地理绘图。
Using R for Data Management, Statistical Analysis, and Graphics 统计函数手册，容易查阅。
Data Mining with R Learning with_Case Studies 用例子来讲解数据挖掘，有点难度的。如果能将这几个案例全部照着做一遍应该会极有收获。还有一本关于数据挖掘的是Data Mining with Rattle and R，对于数据挖掘的流程讲解很好，偏向于使用R的一个扩展包rattle。
R in Nutshell（推荐），果壳系列图书之一，讲解全面，索引非常有用。我将它全文打印出来放在桌头参考。
The R Book（推荐），公认的好书，极为全面，章节编排有序，由浅入深，包含内容很丰富。但此书排版不大好，另外出版时间较早，一些新的函数包没有涉及。
Data Analysis and Graphics Using R（推荐），综合性的统计分析教程，没有很多公式用用各种案例讲解统计模型，覆盖面和the R book不相伯仲，出版时间较近。
Lattice Multivariate Data Visualization with R和ggplot2 Elegant Graphics for Data Analysis（推荐）这两本都是关于R高级绘图的教材，一个着重于lattice包，另一个着重于ggplot2包，前者学习入门较快，后者略有难度但潜力无穷。
扫码加好友，拉您进群
全部版块
我的主页
收藏
