基于转录组测序的青叶胆獐牙菜苦苷生物合成相关基因表达研究
青叶胆是一味传统中药材,来源于龙胆科獐牙菜属植物青叶胆(Swertia mileensis T.N.Ho et W.L.Shi),对于黄疸型肝炎有显著疗效;其主要有效成分为獐牙菜苦苷,有着良好的保肝、利胆作用。青叶胆药材主要依赖于野生资源,近年来大规模无节制的采挖,使得青叶胆野生资源数目锐减,难以满足市场需求。
通过探讨青叶胆中獐牙菜苦苷生物合成的遗传基础,找到獐牙菜苦苷生物合成的关键酶基因,能够为体外生物合成獐牙菜苦苷奠定基础。本研究利用Illumina Hiseq 2500高通量测序技术,对青叶胆进行转录组测序,筛选得到与獐牙菜苦苷生物合成相关候选基因(GPPS-1、GPPS-2、GES、G10H-1、G10H-2、IS、DL7H-1、DL7H-2、SLS),探讨了候选基因的表达量与獐牙菜苦苷的关系,克隆得到了与獐牙菜苦苷生物合成显著正相关的关键酶基因。
具体研究结果如下:对青叶胆全株进行了Illumina Hiseq 2500高通量测序后,经过数据拼接、组装后共得到68,643条Unigenes,平均长度为901 bp;共 ...