基于转录组学的小菜蛾脑神经肽的鉴定与表达规律研究
本文对小菜蛾脑组织转录组进行了测定及分析,明确了幼虫期脑组织中基因的组成和种类以及它们在菜蛾盘绒茧蜂寄生后的数字表达谱,从中鉴定出一批脑神经肽基因,并用qrt-PCR的方法检测和比较了他们在寄生和未寄生小菜蛾脑组织中的表达模式。现将结果总结如下：1.小菜蛾脑组织转录组测序及功能注释使用Illumina测序技术对小菜蛾脑组织转录组进行测序,共得到7,115,762个reads,总长度为1,280,837,160个核苷酸,reads平均读长为180bp。
Reads通过系列拼接得到42,441个unigene序列。E值的阈值为1.0E-5时有19,144个unigene在Nr有序列相匹配。
可注释序列中85.5%的比对结果E值在1.0E-50到1.0E-5之间；相似度的分析发现34.6%的序列与比对上序列的相似度大于60%。比对时排第一的序列进行物种分析发现,比例最大的是意大利蜜蜂26.3%,同为鳞翅目的家蚕占5.79%。
2.神经肽基因的鉴定根据Nr功能注释结果,发现转录组数据中有19种已知的神经肽基因EST序列,它们是：Allatost ...