南方科技大学成立大会暨2012年开学典礼9月2日在南方科技大学深圳第一校区举行。南科大校长朱清时在典礼致辞中表示，改革创新是南科大的立校之本。在未来的发展道路上，南科大必将以更大的气魄、胆识和力度推进各项创新，完成南科大作为国家高教综合改革试验校的重大使命。
作为我国高校教改的“试验田”，南方科技大学于2007年5月启动筹建。
2011年3月1日，南科大首届教改实验班的45名学生入学。
2012年4月16日，教育部公布《教育部关于同意建立南方科技大学的通知》，南科大正式“去筹转正”。
2012年5月底，南科大公布2012年招生方案，采用高考成绩占60％，高中平时成绩占10％，南科大复试成绩占30％的综合评价录取模式。
2012年7月，南科大从全国8个省共录取新生188人，新生高考平均成绩超出一本分数线69．475分，已经达到985高校的中上游水平。