天然无内含子mRNA转运出核顺式作用元件的预测与功能鉴定
背景:mRNA转运出核一直是RNA领域的研究热点与难点,近些年的研究中发现mRNA中存在调控其转运出核的顺式作用元件[1]。在高等生物中,出核转运与剪接过程是关联十分密切的。
在mRNA发生剪接过程时,剪接复合体会直接招募出核转运复合体并共同完成剪接与出核两种生命活动[2-5]。删除基因的内含子后,mRNA会因为剪接事件的终止而被阻滞在细胞核内[6]。
所以在剪接与转运出核相偶联的mRNA中,内含子就成为转运出核的顺式作用元件[7]。天然无内含子mRNA占全部mRNA的5%,其中包含着像干扰素、组蛋白等对生物体的生命过程非常重要的基因[8]。
天然无内含子mRNA其本身因不具有内含子而不会发生剪接过程,那么这些天然无内含子的mRNA是否同样存在转运出核的顺式作用元件呢?本实验室在之前对4个天然无内含子mRNA(HSPB3、IFNα1、IFNβ1,、c-Jun)的研究中,发现4条mRNA中的保守序列CAR-E(促细胞质区域聚集元件)能够促进已阻滞在细胞核内的β-球蛋白c DNA转运出核[9]。那么在更大范围的天然无内含子mRNA中 ...