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2013-08-08

在药品毒理学中,经常需要计算和分析一个指标:LD50。它的全称是Lethal Dose 50%(半数致死量),是指能够引起试验动物一半死亡的药物剂量,通常用药物致死剂量的对数值表示。LD50在药品研发中的地位十分重要,因为它是衡量药物毒性大小的常用指标,是评价药物安全性的关键指数,是申报新药过程中必须提供的药理学资料,也是药监部门评价药物优劣的重要依据。

LD50及其对应的置信区间通常是由“Dose-Response(剂量-反应)”模型得出的。从统计技术上讲,建立剂量-效应模型,一般需要通过Probit(概率单位)分析将剂量-效应的S型曲线关系转化成线性关系,然后就可以利用回归方程推算出各效应水平的相应剂量值,尤其是半数致死剂量(即LD50)及其95%的置信区间。

这个计算过程非常复杂,手工计算几乎不可能,一般都是借助统计软件实现的。JMP Clinical软件能便捷地通过菜单计算LD50,效果很好。笔者用JMP ClinicalSPSS两款软件分别进行了试验和分析,以下是操作步骤和分析报表。

假定我们现在研究抗疟药环氯胍对小白鼠的毒性,试验结果如下表所示:

Dose

Total

Death

DeathPct

1

10

1

0.1

10

10

3

0.3

30

10

4

0.4

50

10

6

0.6

其中的Dose为剂量、Total为试验动物数、Death为死亡动物数,DeathPct为动物致死率,试计算环氯胍的LD50及其95%的置信区间。

一、操作步骤

在JMP软件中的菜单路径是“分析 〉拟合模型”,按如下所示在对话框中进行设置: 1.bmp

在SPSS软件中的菜单路径是“分析 〉回归 〉 Probit…”,按如下所示在对话框中进行设置: 2.bmp

虽然两者的操作界面不同,但实际上大同小异,操作都比较方便。

二、分析报表

从统计分析结果来看,两个软件都能计算出模型中的参数估计值、卡方检验的P值、预测的置信区间等内容,没有什么分别。只是在统计结果的图形化表达方面差异很大。

JMP软件能够输出如下所示的“回归图”、“预测刻画器”、“逆预测”图等多种表达图形方式。

5.bmp 4.bmp 3.bmp








通过这些图表,药品统计师们能从“回归图”上了解构建出来的“剂量-效应”模型曲线的整体效果如何,从“预测刻画器”上动态地、精确地预测出不同的剂量导致的致死率分别会是多少。“逆预测”图更有价值,直观地把环氯胍的LD50及其95%的置信区间图文并茂地展现在分析人员面前,即使管理人员也很容易看懂。

在这方面,SPSS的功能显得不足。它只能输出一种如下所示的“Probit转换”图,也有一定的统计意义,但是无法把我们最关注的LD50及其95%的置信区间在图形上表达出来。如果要读取环氯胍的LD50值及其95%的置信区间,就必须去查那个冗长的统计输出报告,不够friendly

6.bmp

JMP和SPSS都是大公司的产品,在医学统计界都有不错的声誉。只是从统计分析的可视化和易用性考虑,笔者更偏好JMP。

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2013-8-8 13:33:14
mee too
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2013-8-11 09:57:35
各软件的特点和侧重点有所不同,
不好用一个软件的擅长方面来比另外一个来比。
比较方法欠科学!
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2013-9-11 23:32:26
kuangsir6 发表于 2013-8-11 09:57
各软件的特点和侧重点有所不同,
不好用一个软件的擅长方面来比另外一个来比。
比较方法欠科学!
个人认为这样的比较才科学,合适的才是最好的,LZ就是看中了可视化和易用性而选择JMP,并没有说SPSS不好。
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2013-9-11 23:37:00
xiaokan214 发表于 2013-9-11 23:32
个人认为这样的比较才科学,合适的才是最好的,LZ就是看中了可视化和易用性而选择JMP,并没有说SPSS不好。 ...
文不对题!
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2013-9-15 12:34:17
kuangsir6 发表于 2013-9-11 23:37
文不对题!
可能我的表达能力不够。我想说的是我们看待问题的角度不同。你可能觉得比较两个软件应该从各个方面完全客观绝对的比较才能达到“科学”。而我觉得实用至上,LZ对可视化、易用性需求最大,那么JMP就在这两项上是优势,那么毫无疑问在JMP与SPSS中他会选择JMP。即使SPSS也有它的长处,但是那并不是LZ想要的
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