我倒不知道有没有相关的函数，不过可以编一下：

x1=-2.9:0.01:2.9;
x2=x1;
m=size(x1,1);
n_elements=zeros(m+1);       % preallocation

for i1=1:m+1
    for i2=1:m+1
          if i1==1
                ind1=y(:,1)<x1(i1);
          elseif i1==m+1
                ind1=y(:,1)>x1(i1);
          else
                ind1=y(:,1)>=x1(i1-1) & y(:,1)<x1(i1);
          end
          if i2==1
                ind2=y(:,2)<x2(i2);
          elseif i2==m+1
                ind2=y(:,2)>x2(i2);
          else
                ind2=y(:,2)>=x2(i2-1) & y(:,2)<x2(i2);
          end
          n_elements(i1,i2)=sum(ind1 & ind2);
    end
end

另外如果想看3维直方图的话，可以考虑hist3这个函数。。

谢谢！