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Fisher精确检测的p值进行负对数转换的问题
chris1998
6251 5
2013-10-08
请教：如果计算得出Fisher的p值为3.131173e-54，那么对其进行负对数转换（negative log-transformation）时是使用-log(3.131173e-54,10)，还是直接使用-log(3.131173e-54)？ 这两个转换方式的区别是什么啊？谢谢！
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chris1998
2013-10-9 14:30:40
唉，自己顶一哈啊～
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lanyajia
2013-10-9 16:34:43
用-log(3.131173e-54,10)，转化的尺度是常用对数，即以10为底的对数；
用-log(3.131173e-54)，转化的尺度为自然对数，即以e为底的对数。
两种转化是等效的，至于该使用哪一个，要看将转化结果用于做什么。比如转化的结果主要应用于改变数据分布的表现，则两者都可以。如果要将结果用于进一步计算，则要看计算公式中需要的是常用对数还是自然对数了。
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chris1998
2013-10-9 18:51:38
非常感谢您的回复！我现在遇到的情形是这样的：我首先对一个样本的60个特征进行了考察，发现其中50个特征的分布具有明显的统计学差异；然后，我将这50个特征按照某一特定的标准划分为6组，每一组里成员数量并不一定相等，我现在想看看这6组到底最后按显著性是怎么样排列的。我同学告诉说可以将具有显著性差异的50个特征的fisher p值进行负对数转换（negative log-transformation），然后将各组中每个成员各自对应的转换值相加就可以进行排序比较了，所以就有了现在以10为底还是以e为底进行转换的问题。
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lanyajia
2013-10-9 18:57:40
如果是这样，两种转换方式对最终结果没有影响，你可任选其一。以e为底的对数更为常用，因为这是对数转换的默认方式。
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chris1998
2013-10-9 19:18:23
灰常灰常感谢啊～ 真是我的大救星啊～
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