bysort  ID: egen new_gender=mean(gender)

还有一种情况：
ID    year     age
1      2000     .
1      2004    68
1      2006     .

怎么通过2004年的年龄把2000年和2006年的年龄补上，如果这个case在2000和2006年在其他变量上是有数据的？

上面两种命令都是可以解决你的问题的啊
你执行就可以看到结果啊

. clear

. input ///
> ID       year       gender

            ID       year     gender
  1. 1         2000        .
  2. 1         2002        1
  3. 1         2004        .
  4. 2         2000        .
  5. 2         2002        .
  6. 2         2004        2
  7. end

.
. bysort ID : egen new_gender=mean(gender)

.
.
. bysort ID (gender):replace gender=gender[1] if gender==.
(4 real changes made)

. list

     +-------------------------------+
     | ID   year   gender   new_ge~r |
     |-------------------------------|
  1. |  1   2002        1          1 |
  2. |  1   2004        1          1 |
  3. |  1   2000        1          1 |
  4. |  2   2004        2          2 |
  5. |  2   2000        2          2 |
     |-------------------------------|
  6. |  2   2002        2          2 |
     +-------------------------------+