已经搞定了，问题在这两行

log using "D:\Program Files (x86)\Stata12\log" s`fn1'`fn'.log, text replace
cmdlog using "D:\Program Files (x86)\Stata12\log" c`fn1'`fn'.log, replace

stata 好像不能识别有空格的目录
我把日志文件放到 D:\log下，就可以了

我也遇到了同样的问题，并且目录没有空格，请教楼主应该怎么解决呢。。。

看看C盘下有没有stata13.1\do 这样的文件夹

楼主，您好，我遇到的问题是  invalid 's'。请问该怎么解决呢

应该是楼主的引号打错了位置。
log using "D:\Program Files (x86)\Stata12\log" s`fn1'`fn'.log, text replace
应该是：
log using "D:\Program Files (x86)\Stata12\log\s`fn1'`fn'.log", text replace
请注意引号和斜杠的位置。