1.matlab的语法更适合于矩阵操作。R的矩阵操作就要稍弱一点了。

2.R有大量的新的且高质量的包可用。如果一个研究者提出了一个新算法，实现这个算法的R包很快就出来了。但是，matlab几乎无这种可能。不过，matlab提供了很多工具箱，是成熟的、组织良好的一些算法的实现。包和工具箱，就好比是零售和批发的关系。哪个更好，依人而论。

3.R是免费的，轻量级的。matlab的很贵的，并且也是很笨重的。

4.在统计学方面，特别是在内置函数数量和质量以及处理大数据集的能力上，R要优于matlab。

5.R有CRAN，在这里几乎可以找到所有需要的东西，包括最新的算法的实现和常用统计技术。matlab的论坛东西相对较少。

6.matlab的文档写的更好。

7.matlab的UI比R更漂亮，不过Rstudio差不多弥补了R的这个不足。