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基于RCS的logisitc回归预测OR值置信区间的绘制
楼主
moonstone
6633
1
收藏
2016-03-17
采用Frank E Harrell Jr教授写的SAS宏“PSPLINET”可以分别构建基于RCS的COX及logistics回归模型,也可以输出相应的置信区间,但是该宏存在的局限是:绘制的置信区间无法选取参考点,也即在参考点的OR或RR值为1。
相应的宏来源:
http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/pub/Main/SasMacros/survrisk.txt
相应的宏简介:
http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/SasMacros
R中的Hmisc::rcspline.plot函数虽然明确说可以绘制置信区间,但是测试后发现绘制不了。
明确基于RCS的logisitc回归预测OR指置信区间的绘制原理,其实就是通过计算得到个体水平预测的OR及置信区间后,然后画图的问题。所以关键问题是:如何输出个体水平预测的OR值的置信区间。SAS的proc logistic的output选项XB似乎可以输出个体预测的OR值,但是没办法输出XB的置信区间。stata的predictnl可以获得相关值。
以下是绘制基于RCS的logisitc回归预测OR值置信区间的示例(
示例数据仅供交流,并不一定具有实际意义)
。
webuse mksp2, clear
mkspline dose = dosage, cubic nknots(4) displayknots
logistic outcome dose*
predictnl pred = _b[dose1]*(dose1-48) + _b[dose2]*(dose2-10.547238) + _b[dose3]*(dose3-0.39063844), ci(lo hi)
gen OR = exp(pred)
gen LCI = exp(lo)
gen UCI = exp(hi)
twoway ///
(line OR LCI UCI dosage, sort ///
lp( l longdash longdash) lc(black black black) ///
lw(medium medium medium)) , ///
scheme(s1mono) ///
ylabel(0.01 0.1 1 10 100 1000, angle(horiz) format(%3.2fc)) ///
xlabel(0(10)100) ///
yscale(log) ///
ytitle("Odds Ratio", margin(right)) ///
legend(on position(10) ring(0)) ///
plotregion(style(none))
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沙发
drh324
2016-8-30 14:59:33
你好,感谢分享,请问
(dose1-48) + _b[dose2]*(dose2-10.547238) + _b[dose3]*(dose3-0.39063844), 这里面,减去的值是什么值?谢谢
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