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R求作物的遗传力及其参数或BLUP的软件包
lnxu
16310 12
2009-04-25

请前辈指教2个问题：

1。如何用R求作物的遗传力及其参数

2.如何用R求BLUP  ，软件包是那个

谢谢

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yahoocom
2009-4-25 23:15:00
这个专业性太强了，可能了解的人不多。
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shfujim
2009-8-20 16:19:24
这个有点为难R罗，要进行BLUP计算，数据量肯定不是一般级别的拉。R里面有一些包是做数量遗传分析的，但是都很有限，MCMCglmm，qgen等。推荐用PEST，WOBAT，Asreml进行分析。前两个是免费软件，后面的是商业软件，提供30天试用。
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Biostatistician
2009-8-24 20:20:39
楼上说的对，我也补充一个软件，叫DMU，我们课题组就用这个，挺不错的，为了速度别考虑R算方差组分和BLUP了
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shfujim
2009-8-28 19:06:22
Biostatistician 发表于 2009-8-24 20:20
楼上说的对，我也补充一个软件，叫DMU，我们课题组就用这个，挺不错的，为了速度别考虑R算方差组分和BLUP了
我也有WOMBAT软件，就是原来的DFREML。不过他那个好像要在LInux下面计算的更快些，再Windows下面运行效率不是很高，软件作者已经就事先申明的。请问楼上怎么解决这个问题的阿？学习Linux么？我们课题组准备买个商业软件的？给点建议吧？谢谢。
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zhumengjin
2009-12-20 14:03:55
免费软件MatVEC也可以用来估计BLUP。
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