像这样

试了，好像不行啊
如下：my.dataset <- data.frame(site=c('A','B','A','A','B'),
season=c('Winter','Summer','Summer','Spring','Fall'),
pH = c(7.4,6.3,8.6,7.2,8.9))
my.dataset1 <- data.frame(site=c('A','A','B'),
  season=c('Winter','Spring','Fall'),
pH = c(7.4,7.2,8.9))
> d2<-my.dataset[my.dataset%in%my.dataset1==FALSE]
> d2
  site season  pH
1    A Winter 7.4
2    B Summer 6.3
3    A Summer 8.6
4    A Spring 7.2
5    B   Fall 8.9

没怎么看懂，a1与b1您设的是一样的，能否用我上面贴的数据集试一下？非常谢谢！

最好的方式是给两个数据集设统一的ID字段