假设数据是data.frame，变量名是dat，全部列是数值型。
# 最小值
sapply(dat, function(x) {x[x == 0] <- NA; min(x, na.rm = TRUE)})
# 对应位置
sapply(dat, function(x) {x[x == 0] <- NA; which(x == min(x, na.rm = TRUE))})

谢谢，已解决，最后的用了下apply，设置了Index 的维度，因为要对列计算，少了2最后的结果是按行计算的
就是：apply(m,2,function(m){m[m==0]<-NA;min(m, na.rm = TRUE)})，就是这句m[m==0]<-NA这句话还不是很明白，m==0,返回的是true 或false,ture=1,那么m[ture]是表示什么意思？