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2017-06-26
有一个距离矩阵 23288 * 23288(是稀疏的, object.size 1824203192 bytes)想通过dbscan的  "dist" method  来聚类  但是报错了

Error in asMethod(object) :
  Cholmod error 'out of memory' at file ../Core/cholmod_memory.c, line 147  

不知道有什么方法可以处理?
好像可以通过 Matrix的 sprasematrix 转化为稀疏矩阵可以处理,但是没看到能直接转化原有matrix的途径,好像要specifying the locations (row and column) 来转化;
好像也可以通过bigmemory 储存matrix,但是好像使用matrix的时候格式又会有点问题。


好吧 上述只是个人猜测 没用过上述两个包  R怎么处理比较大的数据  没什么经验。
求助~~~~
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2019-10-28 23:09:58
请问out of memory解决了吗
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2019-10-28 23:11:05
yuyuhoney 发表于 2019-10-28 23:09
请问out of memory解决了吗
我的报错也是这样的
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