摘要：microRNA（miRNA）是近几年发现的一类长度为～21nt的内源非编码小RNA，在植物和动物中发挥着重要而广泛的调控功能。它的发现主要有cDNA克隆测序和计算发现两条途径。由于cDNA克隆测序方法受miRNA表达的时间和组织特异性以及表达水平的影响，而计算发现可以弥补其不足，因此miRNA的计算发现方法研究受到了广泛的重视。文章对近几年计算发现miRNA的研究进展进行了综述，根据计算发现方法的本质，将计算发现方法93纳为5类，分别是同源片段搜索方法、基于比较基因组学的预测方法、基于序列和结构特征打分的预测方法、结合作用靶标的预测方法和基于机器学习的预测方法，并对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析，最后探讨了进一步的发展方向。

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