如上提问，在R语言中做差异分析时矩阵有一些0值，对所有值加0.00001并重新写出矩阵，但是只加到40多行，后面依然还是零值。但在R中打开数据矩阵是全部加上的，求大神指点。
代码如下：
meta_exp<-read.table("array.txt",header=T,sep="\t",row.names=1)
mat=as.matrix(meta_exp)
mat=impute.knn(mat)
matData=mat$data
matData=matData+0.00001
write.table(matData,file="newarray.txt",sep="\t",quote=F)