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argparse库怎么设置参数
楼主
不二不幸福
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2018-09-04
有一个python脚本,不用argparse设置参数运行python test.py会产生一个这样的数据框,此时输入数据是脚本里固定的
start end strand
60 235 W
235 418 W
54 500 W
-1 43 C
79 262 C
262 437 C
459 500 C
现在想要在命令行添加参数,比如运行的时候使用python test.py --input data.txt --output result.csv -chr 2 指定输入输出文件,并且结果中增加一列
start end strand chr
60 235 W chr2
235 418 W chr2
54 500 W chr2
-1 43 C chr2
79 262 C chr2
262 437 C chr2
459 500 C chr2
我知道dataframe['chr'] = 'chr2'可以添加列,但是我要运行不同的数据,所以想要在命令行添加各种参数
请问一下脚本里应该添加什么内容?
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全部回复
沙发
jin0575
2018-9-10 22:10:34
May be you can find this will do some helpness: https://docs.python.org/3/library/argparse.html
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藤椅
杨Yuer参上
2018-9-27 21:10:40
使用 sys库就可以, 请参考一下代码
复制代码
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板凳
longgb246
2018-9-29 10:08:21
chr的列写死的情况下。可以这么做:
复制代码
使用 python test.py --input data.txt --output result.csv --chr 2
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