使用R-STUDIO跑KEGG时出现报错:
Error in dimnames(x) <- dnx : 'dimnames' applied to non-array
求解????
代码
setwd("C:/Users/Administrator/Desktop/new/KEGG")
library("clusterProfiler")
rt=read.table("x.txt",sep="\t",head=T,check.names=F)
geneFC=rt$logFC
gene<-rt$ENTREZ_GENE_ID
names(geneFC)=gene
#kegg
kk<-enrichKEGG(gene=gene,organism="human",qvalueCutoff=0.05)
write.table(summary(kk),file="KEGG.xls",sep="\t",quote=F,row.names=F)
文件和目录都没错。
但就是导不出KEGG.XLM
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