真的没人么

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1.你所说的连边规则设置是不是根据边的权值筛选掉权值小的边（阈值设定，netdraw就有这个功能，matlab直接对邻接矩阵设置就行）
2.做计算，大部分参数，比如路径，聚类系数，密度，中心性，matlab计算很方便（直接分析邻接矩阵），更复杂的 ，网络行为建模，需要laplace矩阵，算法可能复杂点了
3.可视化，作图networkx更好看些，节点数多了matlab做的图实在不好看，此外pajek，netdraw作图也行，pajek很好用（网上说gelphi也行，但是可能具体问题具体分析吧，反正我做的网络用gephi效果不如pajek好）
4.network工具箱很完善，如果上手了比matlab自己写代码还方便些