运营管理 物流与供应链 
首先来说供应链的范围比运营管理大,而物流的范畴最小。
如果LZ你只是专注于后端的话,也就是仓储、物流、交付这3个地方的话,从建模计算的角度来说无论GAMS还是CPLEX这类的建模与规划软件,掌握一个就够了吧。没用过CPLEX,但是我记得这个是和MATLAB衔接的吧,是不是MATLAB也得掌握。对我来说MATLAB就是计算器,这部分软件之间联合建模规划的事不了解。
但实际研究,那么基础的ERP软件、SRM、CRM、WMS软件的使用,尤其是数据的抓取肯定要会吧,当然看实际工作,未必要全都会。但是数据的抓取、分析、展示总是逃不掉的,于是EXCEL、POWER BI、SQL、PYTHON、SPSS、R等等总有逃不掉的。
你要是真的涉足运营管理,APS 、MES肯定也逃不掉吧,当然这个其实也是规划软件。
不知道LZ你的研究要研究到什么level,
如果是编程的话,估计Python肯定逃不掉,毕竟粘合剂,在大数据方面目前又大范围使用;
如果是商业建模的话(我过去就做这事),其实这些软件了解+会简单使用即可,商业智慧更重要,反而要多去了解SC+财务+管理+技术等等;
如果是使用的话,碰到什么临时学就好了,没必要研究什么东西。
然而技术都是浮云啊,左手P哥右手E妹才是硬道理。