刚开始学习结构方程的同学可能会比较模糊，应该学习AMOS,还是学习Lisrel呢？
应该说AMOS和Lisrel各有特色，AMOS的最大特色是可视化，易学易懂，不必撰写程序（当然你也可以利用AMOS BASIC）撰写程序），LISREL的特色是可进行多层次模型分析（Multi-level modeling）。如果你的研究涉及到以下方面，就要用到多层次模型分析，也就要学习Lisrel了：（1）多个时间点（例如第一周、第二周、第三周……）的观察，（2）不同的处理（例如不同的广告刺激），以衡量结构（例如以购买率来衡量广告的效果）。在功能上，AMOS和LISREL亦稍有差异：
AMOS提供模型修正与模型设定探索，提供MCMC估计，能够为小样本做适当调整，能够计算直接与间接效果；LISREL提供多层次模型分析，绘图（单变量、双变量和散布图）和同质性检验。另外，LISREL需要用到较为复杂的编程，对矩阵和数理统计有较高的要求。
以上简要分析AMOS和lisrel的区别，新手可以根据自己的研究需要作出选择。