以学科评估能力，清北并列第一。根据教育部第四次学科评估，评估结果按“分档”方式呈现，具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位，将前 70%的学科分 9 档公布：前 2%（或前 2 名）为 A+，2%～5%为 A（不含 2%，下同），5%～10%为 A-，10%～20%为 B+，20%～30%为 B，30%～40%为 B-，40%～50%为 C+，50%～60%为 C，60%～70%为 C-。
位于 A+的学科是我国高校中的王牌学科，清北并列第一。此次学科评估中，共有 513 个高校和科研单位的 7449 个学科参评，全国高校具有博士学位授予权的学科有 94%申请参评。其中共有 81 所高校的 228 个学科获评 A+(中国科学院大学作为科研单位参评)，其中清华大学、北京大学作为我国的王牌大学继续领跑，各有 21 个学科获评 A+，并列居首，中国科学院大学和浙江大学各有 18 个和 11 个学科获评 A+，分列三、四位，中国人民大学有 9 个学科获 A+，列第五位。除此之外，中国科学技术大学、北京师范大学、中国农业大学、复旦大学、上海交通大学、东南大学 6 所高校，各有 5 至 7 个学科获评 A+。
北京无论数量规模还是质量结构，均位列主导地位。从各省份学科评估成绩来看，北京处于遥遥领先的位臵，C-以上学科约占全国的 1/8，A 以上学科约占全国 1/4，A+学科约占全国1/2；上海市在 C-档以上学科总数不如江苏省，但在 A-档以上的优质学科和 A+档学科上具有一定优势。在 C-档以上学科总数上，排在第 4 到第 10 位的省份分别是湖北、陕西、山东、广东、辽宁、浙江、湖南。在 A+档和优质学科方面，湖北省和浙江省分别列在第 4 位和第 5位。表现较好的还有湖南、安徽、陕西、黑龙江、四川、山东、广东等省。辽宁省 C-以上学科总数位居全国前列，但无 A+学科，A 和 A 学科也较少。重庆、河北也缺少 A 以上的高端学科。


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