得把数据贴一下（一部分也可）才可以看出具体问题。

好。谢谢斑斑。

数据1：
bondduration        bondyear        bondmonth   bondyield
5.728498                2005                6                   0.599
5.728498                2005                6                   0.589
5.728498                2005                6                   0.589
5.637138                2005           6                   0.611

数据2：
tbillyield        tbillyear        tbillmonth    tbillduration
.055181        2001                1                 10.86   
.055304        2001                1                 11.32
.055399        2001                1                 13.01
.049923        2001                1                 0.28

append后的数据变成：
bondduration  bondyear  bondmonth  bondyield   tbillyield        tbillyear        tbillmonth    tbillduration
5.728498                2005                6                   0.599        .            .               .                 .
5.728498                2005                6                   0.589        .            .               .                 .
5.728498                2005                6                   0.589         .           .               .                 .
5.637138                2005           6                   0.611         .           .                .                .

这肯定不行的，append必须要数据的变量一样的

这样之后应该生成一个“对角分块阵”型的数据库（其余观测值是缺失值）。

你想生成怎样的数据库？

joinby是需要的，可append不需要变量名一样吧