南京、上海的学校。。。

你的问题比较多啊，我就先回答几个吧。
“是不是综合性大学考公务员比专属类好些”这个问题应该是很模糊的，总体来说，考公务员跟自身的专业有关，跟学校的关系应该不是非常大。不过考公务员一般要比考研的难度大！
“关于歧视的问题”，这是不可回避的问题，很多院校对于招生的要求就是要211类的，对普通院校是有歧视的。当年我考研的时候，也遇到这样的问题。你可以先打听一下你要考研的院校，看看是否很重视学生的本科院校等。
   
   科大企业管理考公务员当然没有问题了。前提是你要能够进去啊！科大的研究生现在竞争力不大，因为厉害的基本上出国了。现在中科大的招生很多都是安大的，我一个同学在科大读企管，听他说待遇很一般的样子！

只想你给楼主几个字：你想的太多了

北京南京上海的还可以，考研不仅仅只追求学术，更要考虑以后的发展，当然，如果你有特别的研究倾向那另当别论！！！

没有什么意思，肯定要选择北京上海南京之一了

恩，你现在还小，关键还是打基础，基础好了考哪里都可以

北京、上海

祝福楼主实现自己的梦想。