个人建议面板数据不太适合进行主成分分析，如果序列是平稳地话可以稍微考虑

1.那要看你对什么进行主成分了。通常都是对指标进行分析，但是你三个指标过少，一旦主成分分析后很有可能提出一个主成分，那就没什么意义。
2.如果选择时间序列，则5年数据要看你是按照年来划分还是按照月或日来分。如果是后者，数据量较大，还能做，如果选择5年的，数据量还是偏少。时间序列和主成分的区别我认为是应用不同。时间序列倾向于时间上的数据，如一家公司10年内120个月的销售量就可以使用时间序列做，而主成分数据更适合面板数据，也就是说在同一时刻如2012年年销售量，用到资金流量，主营业务收入，营业外收入，总产值，营业成本等等指标，然后通过主成分提取主成分分析各个提取的主成分的贡献，然后再做个回归分析什么的。两者侧重点不同。通常时间序列应用在金融计量统计中，而主成分用于多元统计较多。关键看你怎么分割你手头的数据集。