本教程主要针对的对象为R/Bioconductor零基础的一线科研人员,生物信息学在读学生,以及想系统学习与掌握Bioconductor的专业信息分析人员。
本教程的写作目的,是希望通过丰富详实的实例讲解,让对有兴趣自己分析数据的研究人员从零开始,快速学会,理解使用Bioconductor成熟软件包分析基因芯片数据,测序数据等。本教程也非常适合作为高校生物信息学的教程。
本书主要涉及的内容有:
1. R/Bioconductor基础
2. 原始数据的读取
3. 质量控制
4. 差异表达分析
5. 数据可视化手段
6. 基因本体学(Gene Ontology)、路径(KEEG pathway)富集分析
7. 其它相关下游分析,比如motif搜索,基因网络建立等