全部版块 我的主页
论坛 数据科学与人工智能 数据分析与数据科学 R语言论坛
731 2
2021-10-28
如何对CITE_PBMC数据通过在 Seurat 中实施的 Wilcoxon 测试,通过 CD4 和 CD8 基因的差异表达分析来鉴定簇。我现在有CITE_PBMC_counts_top2000.h5的数据(R加载后,如下图一所示),想呈现可视化CD8和CD4蛋白水平 和 RNA簇上蛋白质水平(具体如下图二和图三所示)。但我刚接触该类型数据和R语言,有以下几个问题,希望大神能指点一下:1. 具有最显着高表达的 CD4 和 CD8 mRNA 的簇分别标记为 CD4 和 CD8 T 细胞,该如何根据h5数据来确定CD4 和CD8的T细胞?


2. https://www.jianshu.com/p/e19e76d44287 参考提供的链接(图三为该链接中的RNA簇蛋白质水平可视化图),但是不知道该如何注释当前的数据。

请大神指教!十分感谢!
h5data.jpg

CD8-CD4.jpg

protein.png
二维码

扫码加我 拉你入群

请注明:姓名-公司-职位

以便审核进群资格,未注明则拒绝

全部回复
2021-10-28 21:31:07
这个太专业了,seurat官网有教程的.
二维码

扫码加我 拉你入群

请注明:姓名-公司-职位

以便审核进群资格,未注明则拒绝

2021-10-29 10:02:32
llb_321 发表于 2021-10-28 21:31
这个太专业了,seurat官网有教程的.
大神一句话,菜鸟少十年。感谢大神回复,我本人也初接触这个方向。那请问大神能否提供下Seurat官网上有关的链接吗?或者指点下如何确定CD8和CD4细胞。十分感谢!!
二维码

扫码加我 拉你入群

请注明:姓名-公司-职位

以便审核进群资格,未注明则拒绝

相关推荐
栏目导航
热门文章
推荐文章

说点什么

分享

扫码加好友,拉您进群
各岗位、行业、专业交流群